Vieillissement musculaire : impact de la protéolyse intracellulaire calcium-dépendante

N° d’ordre : 3899


THESE
Présentée à
L’Université Bordeaux 1


Ecole doctorale des sciences de la vie et de la santé

Par monsieur Cédric BRULE

Pour obtenir le grade de
DOCTEUR

Spécialité : Nutrition

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Vieillissement musculaire : impact de la protéolyse
intracellulaire calcium-dépendante
Thèse dirigée par Sylvie POUSSARD et Elise DARGELOS
Soutenue le 25 novembre 2009

Après avis de Mrs.
Daniel BECHET Directeur de Recherche, INRA de Theix
Bertrand FRIGUET Professeur, Université Paris 6


Devant la commission d’examen formée de Mmes et Mrs

Véronique PALLET Professeur, Université Bordeaux 1 Présidente du jury
Daniel BECHET Directeur de Recherche, INRA de Theix Rapporteur
Bertrand FRIGUET Professeur, Université Paris 6 Rapporteur
Isabelle BOURDEL-MARCHASSON Professeur H-U, Bordeaux 2 Examinatrice
Vincent MOULY Directeur de Recherche, CNRS/Université Paris 6 Examinateur
Sylvie POUSSARD Ingénieur de Recherche, Université Bordeaux 1 Directrice de thèse
Elise DARGELOS Maître de conférences, Université Bordeaux 1 Membre invité












































Remerciements


Ce travail a été réalisé au sein de l’Unité Protéolyse, Croissance et Développement
musculaire dans le cadre d’une allocation de thèse accordée par la région Aquitaine.

Je tiens tout d’abord à exprimer ma gratitude envers Monsieur le Professeur Patrick
COTTIN pour m’avoir accueilli au sein de son laboratoire et pour m’avoir prodigué une
quantité impressionnante de conseils aussi bien pour l’étude des calpaïnes que pour la vie
quotidienne.
J’exprime également ma reconnaissance à Mesdames Sylvie POUSSARD et Elise
DARGELOS pour m’avoir encadrée brillamment et soutenue durant ces trois années. Leurs
précieux conseils couplés à leurs qualités scientifiques et pédagogiques m’ont permis
d’évoluer sereinement lors de l’exercice difficile qu’est une thèse. Sans elles, je ne serais pas
arrivé là ou j’en suis. De plus, je tiens à signaler que nos rapports ont dépassé le cadre du
laboratoire et je me réjouis des contacts humains que j’ai pu entretenir avec elles.

Je tiens à remercier tous les membres du jury, Madame Véronique PALLET pour
l’avoir présidé, Monsieur Bertrand FRIGUET pour avoir jugé ce travail, Madame Isabelle
BOURDEL-MARCHASSON et Monsieur Vincent MOULY pour avoir examiné mon
manuscrit. De plus, je tiens à remercier particulièrement Monsieur Daniel BECHET pour
avoir jugé mon travail ainsi que pour m’avoir accueilli un mois entier dans son unité afin de
récupérer du matériel biologique ainsi que pour acquérir des nouvelles techniques de
laboratoire.

Je tiens également à remercier tous les membres du laboratoire pour m’avoir
supporté pendant ma thèse, ainsi que pour leur bonne humeur et leurs conseils scientifiques.
Un grand merci plus particulier et une grande amitié à Abdessatar HADJ-SASSI, Pierre
LOCHET et Amélie PIRES-ALVES pour leur bonne humeur matinale et leurs conseils
scientifiques (ou non) avisés ; un merci pour Cynthia DUBOURG pour sa disponibilité et sa
gentillesse lors de mes questions incessantes sur l’administratif ; ainsi qu’à tous les autres
membres du laboratoire : Laetitia DAURY-JOUCLA, Jacques RAYMOND, Jean-Jacques
BRUSTIS et Philippe VESCHAMBRE avec qui j’ai pris beaucoup de plaisir à travailler et à
partager des moments agréables.

Je tiens à remercier les personnes que j’ai pu côtoyer à l’ISTAB, Bruno VARICHON
et Julien MONTEL pour les discussions endiablées de pauses déjeuner.

J’adresse mes sincères remerciements à mes compagnons étudiants thésards, Docteur
ou bientôt Docteur : Ludovic, Pascal et Hélène pour leur soutien ainsi que pour leur aide
diverse et variée. Egalement, un grand merci aux stagiaires et étudiants qui ont eu le malheur
de travailler avec moi : Antoine, Audrey, Asmae, Ramata et Laurianne ; je vous souhaite
beaucoup de réussite pour l’avenir.

Je tiens à remercier tous mes amis qui ont cru en moi sans même comprendre un
traître mot de ce que je racontais quand je leur expliquais mon travail.

Enfin, un grand merci à ma très chère épouse qui a enfin compris dans ces derniers
mois le difficile travail de supporter un thésard lors de l’écriture du manuscrit et de la
préparation de l’oral. Rien que pour cela, elle mériterait une médaille. De plus, je la remercie
pour son soutien sans faille lors des moments difficiles.

Merci à toutes les personnes que j’ai pu oublier (toutes mes excuses) et merci à ceux
qui ont lu ou liront ce manuscrit.

















Sommaire

Avant propos ........................................................................................................ 1

Introduction ..........................................................................................................3
ère1 partie : le système protéolytique neutre calcium-dépendant : les calpaïnes......... 4
I Généralités, structure des calpaïnes ............................................................ 5
I A Les calpaïnes ubiquitaires.................................................................. 5
I B Les calpaïnes tissus spécifiques.......................................................... 7
II Localisation des calpaïnes........................................................................ 9
III Régulation de l’activité des calpaïnes ubiquitaires.................................... 10
III A Le calcium.................................................................................. 10
III B Les phospholipides et autres activateurs directs ................................ 11
III C La calpastatine............................................................................. 13
IV Substrats et fonctions physiologiques des calpaïnes.................................. 16
V Les calpaïnopathies .............................................................................. 16

ème2 partie : Le muscle strié squelettique ......................................................... 19
I Organisation cellulaire ........................................................................... 21
I A Le sarcomère................................................................................. 22
I B Le sarcolemme 24
I C Le réticulum sarcoplasmique............................................................ 26
II Les différents types de fibres musculaires ................................................ 27

ème3 partie : Myogenèse et régénération musculaire........................................... 29
I La myogenèse....................................................................................... 30
I A Les facteurs de transcriptions myogéniques........................................ 31
I B Implication des calpaïnes au cours de la myogenèse ............................ 32
II La régénération musculaire.................................................................... 33
II A Les cellules satellites : activation de la régénération ........................... 34
II B Les cetellites : régulation de la régénération 36

ème4 partie : Les atrophies musculaires et le système protéolytique neutre calcium-
dépendant............................................................................................................... 39
I La myopathie de Duchenne..................................................................... 41
II La LGMD2A....................................................................................... 43
III La sarcopénie ou vieillissement musculaire............................................. 46
III A Apoptose et vieillissement musculaire 46
III B Le stress oxydant et son rôle au cours du vieillissement musculaire ..... 49
III B 1 Les bases des ROS ................................................................ 49
III B 2 Stress oxydant et vieillissement ............................................... 52