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UNIVERSITÉ BORDEAUX II - VICTOR SÉGALEN
Année 2010 Thèse n° 1794
THÈSE
pour le
DOCTORAT DE L’UNIVERSITÉ BORDEAUX II
mention : Sciences, technologie, santé
option : Biochimie
présentée et soutenue publiquement le
16 décembre 2010
par
Thibaud RENAULT
né le 30 décembre 1985 à Thouars
Régulations de la protéine proapoptotique Bax
rôle des kinases Akt et GSK-3b
et de la protéine antiapoptotique Bcl-xL
Membres du jury :
M. Érick DUFOURC, directeur de recherches, CNRS Bordeaux Président
M. Philippe JUIN, de INSERM Nantes Rapporteur
M. Jérôme ESTAQUIER, directeur de recherches, INSERM Créteil
Mme. Francesca DE GIORGI, chargée de INSERM Bordeaux Éxaminatrice
M. Abdel AOUACHERIA, chargé de recherches, CNRS Lyon Éxaminateur
M. Stéphen MANON, chargé de CNRS Bordeaux Directeur de ThèseÀ mon frère, Simon.
À ma famille et mes amis.
Une civilisation sans la Science, ce
serait aussi absurde qu’un poisson
sans bicyclette.
Pierre Desproges (1939–1988)
Vivons heureux en attendant la mortATTENTION ! Cette thèse contient 2,2 zeptomoles de Bax.Remerciements
Ce travail de thèse a été réalisé à l’Institut de Biochimie et Génétique Cellulaires à Bordeaux au sein
rde l’équipe Mitochondries, Stress et Morts Cellulaires sous la direction du D Stéphen Manon.
r rEn premier lieu, je tiens à remercier les membres du jury, le D Érick Dufourc, le D Philippe Juin,
r r rle D Jérôme Estaquier, le D Francesca De Giorgi et le D Abdel Aouacheria d’avoir pris part à l’évalua-
tion de ce travail. Je garderai un très bon souvenir de la discussion passionnante qui a eu lieu lors de la
soutenance.
Ces quelques années passées à l’IBGC auront été particulièrement agréables et enrichissantes notam-
ment grâce aux personnes admirables que j’ai eu la chance de côtoyer.
À mon directeur de thèse, Stéphen, un très grand merci ! Merci tout d’abord de m’avoir fait confiance
et laissé une liberté très appréciable dans la réalisation de mon travail. Merci de m’avoir fait partager une
passion pour la recherche, d’avoir été très présent pour me conseiller. Capitaine d’un équipage d’Ama-
zones au caractère fort, le spectro dans l’œil et le chronomètre au bout des lèvres.
Nadine, merci d’avoir été présente pour me conseiller et répondre à mes questions les innombrables
fois où j’avais perdu Stéphen ! Bon courage sur la route
Gisèle, ¡ muchas gracias ! pour ta gentillesse et ton soutien sans failles, en particulier au cours de ces
longues heures que nous avons passées en chambre froide à préparer des mitochondries. Merci pour le
thé salvateur du matin qui m’aura aidé à tenir le coup ! Je te souhaite un repos bien mérité et de profiter
de ta famille !
Muriel, merci pour tes précieux conseils, pour les nombreuses discussions, scientifiques ou non, que
nous avons eues. Je te suis également très reconnaissant de m’avoir initié au monde de la culture cellu-
laire.
Florian, je suis très heureux d’avoir fait ta connaissance et d’avoir partagé de très bon moments. J’es-
père que tu ne vas pas te sentir trop seul désormais parmi toutes ces filles. Je te souhaite toute la réussite
que tu ne manqueras pas d’avoir pour la fin de ta thèse !
iREMERCIEMENTS
Je tiens à exprimer toute mon amitié aux personnes que j’ai rencontrées au cours de la vie de l’équipe ;
èmeMaïka, Noëlle, Cécile, Xavier, Ingrid, Rui, Dario, Sara, ainsi qu’aux membres des équipes des 4 et
ème5 étages que j’ai côtoyés tout au long de ma thèse. En particulier, Patrick , Johann et Marion (bon
courage à vous deux pour la dernière année).
AJe remercie Emmanuel pour son aide et ses conseils sur LT X lors de la rédaction de cette thèse etE
Julien pour son aide à la réalisation des images des structures tridimensionnelles de Bax.
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iiSommaire
I Introduction 3
1 Morts cellulaires 5
2 Mécanismes moléculaires des morts cellulaires 15
3 La mitochondrie, organite central de la voie intrinsèque de l’apoptose 33
4 La protéine proapoptotique Bax 59
Objet de l’étude et stratégie mise en œuvre 75
II Résultats 77
1 Caractérisation du rôle des kinases Akt et GSK-3b sur le processus d’activation de Bax 79
2 Rôle de la protéine antiapoptotique Bcl-x sur les changements de conformation de Bax 111L
3 Mise en œuvre d’une méthode de criblage 133
III Discussion et perspectives 139
Discussion 141
Perspectives 144
IV Matériels et Méthodes 151
1 Biologie moléculaire 153
2 Biologie Cellulaire 161
3 Biochimie 165
4 Bioinformatique 171
1SOMMAIRE
Table des matières 174
Table des figures 180
Nomenclature 185
Index 187
Bibliographie 189
2Première partie
Introduction