Qualité des eaux côtières du Sud du Golfe de Gascogne par télédétection spatiale : méthodologie de détermination et de quantification de substances particulaires et dissoutes

N° d'ordre : 3943

THÈSE

Présentée à

L'UNIVERSITÉ BORDEAUX I

École Doctorale des Sciences et Environnements

ellePar M Caroline PETUS

Pour obtenir le grade de

DOCTEUR

Spécialité : PHYSIQUE DE L'ENVIRONNEMENT


QUALITE DES EAUX COTIERES DU SUD DU GOLFE DE
GASCOGNE PAR TELEDETECTION SPATIALE
Méthodologie de détermination et de quantification de substances
particulaires et dissoutes


Soutenue le 18 décembre 2009

Après avis de :

M. Jean Paul Deroin, Professeur, Université de Reims Champagne-Ardenne Rapporteur
M. Sylvain Ouillon, Directeur de recherche IRD, LEGOS Toulouse Rapporteur

Devant la commission d’examen formée de :

M. Gérard Blanc, Professeur, Université Bordeaux 1 Examinateur
M. Guillem Chust, Chercheur, AZTI Sukarrieta Examinateur
M. Christian Germain, Professeur, ENITAB Examinateur
M. Daniel Villessot, Directeur scientifique, Lyonnaise des Eaux Examinateur
meM Séverine Jacquet, Chercheur, Lyonnaise des eaux Directeur de thèse
M. Jean-Marie Froidefond, Chargé de recherche CNRS, Université bordeaux 1 Directeur de thèse

− 2009 -




























La thèse, c'est un peu comme un long périple en bateau, cap vers l'inconnu. Le voyage
commence avec motivation et excitation, puis il y a les vagues, les creux et les premières
tempêtes où le navire prend l'eau... On se prend parfois les pieds dans les filets, on doute, on
se trompe de direction... Au détour d'une route, on fait souvent de belles rencontres et parfois
aussi nos chemins croisent quelques «pirates» de la science! Malgré tout, nombreux sont les
rayons de soleil éclairant le parcours, et finalement, lorsqu'on touche enfin au but et que l'on
se retourne sur les trois années passées, on en ressort grandi et la tête pleine de beaux
souvenirs! Je viens d'accoster en terre ferme et je tiens à remercier l'ensemble des personnes
qui m'ont permis, de près ou de loin, de mener ma barque jusqu'au bout!
Mes remerciements vont dans un premier temps à mes encadrants : Séverine Jacquet et
Jean-Marie Froidefond. Cette thèse n'aurait pas pu voir le jour sans les moyens qu'ils m'ont
accordés, leur confiance et la totale liberté qu'ils m'ont laissé au cours de ces trois ans. Un
grand merci également à l'ensemble des membres de mon Jury, pour leurs remarques, leurs
conseils, leur intérêt et leur dynamisme au cours de la soutenance. Merci à Sylvain Ouillon et
Jean-Paul DEROIN d'avoir accepté d'être rapporteurs de ces travaux, à Gérard Blanc,
directeur de ce Jury, et à Guillem Chust, Daniel Villessot et Christian Germain qui ont
rapporté cette thèse.
Mes premières ébauches scientifiques ont eu lieu entre Paris et la Colombie, au cours de
mon stage de Master 2. Je tiens sincèrement à remercier Yves-François Thomas de m'avoir
permis de réaliser cette belle expérience qui m'a profondément marquée. Un énorme merci
pour votre gentillesse, votre disponibilité et les conseils que vous avez su me donner tout en
me laissant une grande liberté. J'ai pu, grâce à vous, découvrir la science «que j'aime», une
science appliquée à des problématiques concrètes, utiles et sans se prendre au sérieux. Un
grand merci également à Carolina pour son accueil et pour m'avoir fait découvrir son pays et
également à tous ceux que j'ai pu croiser à INVEMAR pour leur gentillesse et leur bonne
rhumeur! Tous mes remerciements également à M Castaing qui m'a pris sous son aile lors de
mon retour en France et qui m'a permis de terminer mon travail dans les meilleures
conditions. Merci pour votre aide, vos conseils et votre franchise, tout au long de mes années
d'études à Bordeaux.
Je souhaite également remercier les membres de mon comité de thèse pour leur soutien et
leur disponibilité au cours de ces trois ans. Tout d'abord, un très grand merci à Francis Gohin
qui a toujours été intéressé et enthousiaste au sujet de mes travaux, qui m'a fait confiance et
grâce à qui j'ai maintenant un CDD à l'Ifremer. Merci à Guillem Chust de m'avoir initiée aux
statistiques, pour sa gentillesse et pour les missions en mer partagées. Enfin, merci à Denis
Morichon pour son aide tant scientifique qu'humaine.
Merci également à tous ceux que j'ai pu croiser au détour d'une conférence ou d'une mission
en mer. Tout d'abord David Doxaran, qui a eu la gentillesse de participer à mon article et
sans qui je serais toujours en train de relire mon «bad english», Virginie Lafon qui m'a aidée
et conseillée sur l'utilisation des images satellites ainsi que Mathilde Montperrus, David Amouroux, Damien Dailloux , Stefani Novoa et tous ceux avec qui j'ai pu partager de beaux
moments en mer et quelques bières!
Passons maintenant au laboratoire EPOC. Pour commencer, le petit Domi!! Ah là là, que
cela va me manquer tes petites boutades du matin (toujours fines et subtiles), plus
particulièrement sur mon léger excès de cigarette et sur ma délicate voix de «Roger le
Camionneur» !! Tu es quelqu'un d'adorable, merci de m'avoir écoutée quand j'en avais gros
sur la patate et pour ton grand sourire qui fait du bien au moral! Et viva «la vaca libre»!. Un
grand merci également à Bruno Malaizé (une touche de douceur dans ce monde de brutes), à
Nadia Sénéchal, Aldo Sottolochio, Frédérique Eynaud, Sébastien Zaragosi, Jacques
Giraudeau, Pierre Anschutz, le fameux «comité des fêtes» (Gérard, Bernard et Joël),
Kathy, Jean-Michel Escalier et tous ceux que j'oublie!

Cette thèse aura avant tout été une belle expérience humaine et je tiens à remercier de tout
mon cœur mes amis et ma famille.
Et pour commencer, une dédicace toute particulière aux membres du Bureau Caraïbes, alias
«Rafoufou et les Rafoufounettes», pour les beaux moments partagés au cours de ces trois
ans de cohabitation (avant que Raf ne nous abandonne lâchement!) Difficile de résumer en
quelques mots tout ce qu'on a pu vivre ensemble : galères/délires/dérives
alcooliques...Aurélia, tu es quelqu'un de formidable avec un cœur gros comme ÇA, et plus
encore! (prend bien garde à ton genou!), Aurélie, perchée la haut sur ta planète (en
compagnie des extraterrestres, d'Antoine et de la jolie petite Irène), tu veilles sur nous avec ta
grande sagesse et ton extrême gentillesse, et Rafoufou, tes blagues décalées et ton petit côté
maladroit font tout ton charme : ne change surtout pas! Vous avez toujours été là pour moi
dans les bons et les mauvais moments, dans les fêtes (nombreuses) et les fous rires! Vous êtes
(ainsi que Marilou et Francky!) de Vrais amis et pour longtemps, j'en suis persuadée! Merci
pour tout et belle route à vous 3!
Il y a aussi la petite Elo qui m'a recueillie telle un oisillon tombé du nid lors de mon arrivée
à Brest! Je ne saurais te remercier assez pour tout ce que tu as fait pour moi ces derniers mois
et également pour toutes les conversations, tout le soutien et tous les beaux moments... Notre
aventure se poursuit en Bretagne miss MarcheZ et ça va envoyer du lourd dans les pubs de
Brest!!! Des énormes bisous également au ptit Nico touffe (la seule personne qui convertisse
les prix en équivalent «pinte» et un vrai bon copain comme je les aime!! Merci également
pour ton aide avec Matlab [faut quand même avoir un pète pour aimer le code!]), à Delphine
(notre fée des temps modernes), à la bande des Castors Juniors : Marion (j'ai toute
confiance en toi, tu vas tout déchirer!!), Loïc (t'es vraiment top comme mec, surtout ne
change pas!) et François (mini morveux qui me fais bien marrer! A bientôt sur Brest!). Je
pense aussi très fort à Romain (alias Mister Chachagne, artiste mystique aux sens sur-
développés qui manie l'appareil photo telle une baguette magique et repousse les assaillants à
coup de chaussette &#