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01 janvier 2010
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PhysioSim – A Full Hard- And Software
Physiological Simulation Environment
Applying A Hybrid Approach Based On
Hierarchical Modeling Using Algebraic and
Differential Systems and Dynamic Bayesian
Networks
Inauguraldissertation
zur Erlangung des akademischen Grades
eines Doktors der Naturwissenschaften
der Universität Mannheim
vorgelegt von
Dipl. Inf. Ciamak Abkai
aus Teheran
Mannheim, 2010
Dekan: Professor Dr. Felix Freiling, Universität Mannheim
Referent: Professor Dr. Jürgen Hesser, Universität Heidelberg
Korreferent: Professor Dr. Reinhard Männer, Universität Heidelberg
Tag der mündlichen Prüfung: 08.10.2010
hitecture.AbstractsimAulation.systemeforysiologicalphbasisysiologicaltomo,dsuggestedeulateslhologicalingdepandysimtoulationeisthepresenextensibleted.togetherThedummarcaddhareitecturebisisconsid-stronglyeringds,hhes.ardwdareeducationalandvsoftinwextensivaresoftsupppurportvforthereal-timenophvironmenysiologicalicsimIBPulators,wwhicapproachthearereasoning,vineryFimpwortanmonitoring,tysiologicalforosedmedicaltheeducationtheandconriskysiologicalmaandnforagulator,emendelst.toInpconal-traryhtodesignotheraremoaredelingormethogenericds,orksinbthisrealized.wonenorktotheelfoulatorcusincludingis,toeproSaO2videsignalsmaximaltomosignaldelingmoexibilitwithyanalyzedandofextensibilitphyh.inThaismedicalistheprotovidedconceptsonmedicalthehonetohandpsycb3ymethoademonstratinghierarcapplicabilithicalofmoapproacdeliInngtrarynotationphinmoXMLelingandanalysisonols,otheranhandsimbthymoextendinghacurrenetbmethocomdsutedbreytimedynamicwhicstorequirescehasticofsystemhardwmoanddweling.arcDynamicFBathisyoseesianandNetframewwhaorkseaseenwandellAllascompdeterministictssystemleadmoadelingvbphysimsystemsenoft,algebraicaandydierenwhtialheqmuECG,ationsandleadvitaltoinwitionardssoftaaresophisticatedsimenThevironmendelingthesforDBNmedicalfurthermoresiminulation.domainsSppsycecicandsimysiologicalulationswhicofshouldhaemoedynamicstegratedandtophcommonysiologicalforbasedconsideration.pharmourthermorecokineticssystemandusedphar-shomaconewdforyendablendataamwhiccisarearerelatedppherformedandbhologicalyulations.theproprenZusammenfassungucEinimvundollst?ndigest.SystemulationzurebphVysiologiscchenKardioMobdellierungimmerundVSimonulndaVtingoimnh?mowirddernenpr?senSimtiert.yMeilensteineognitivsindysiologischierarczurhiscvheengMo4dellierungbisherigermitSXMLndundNeueInentegrationvvwieonunddeterministis-FculationhenwSystemihrerbf?resctersuchreibungenhdurcbhvSystemedievanongewinnenlinearenhlie?endalgebraiscneuenhenVundtodigezeigthenerenvtiellenVGle-hictriellerhhaftlicungenstemeoerl?utertderzuKesserungompartimenerfatenMethoundMonicSimhpht-deterministiscSystemenhewstovctersuchastiscvheeispielendynamischeheeSystem-askul?renbdieescerfahrenhreibungenhkdurcdeshscKlationenomtbinationertet.verdenonhestatischhenMounndModynamiscbhenehBaf?ryVes'sctehent.Netzen.dasDievSystemarconzeptenhitekturesserungsiehhktPheineeingesetzt,dynamisc-he-Inphtegrationulationenvatienon?pftHardwdieareor-(EmNaculations-Inteileterfaces)indus-unduSoftwissenscwherarey(zus?tzlicundheerfahrenphuysiologiscAns?tzeherMoerbdelle)aufgezeigt.vVor.hDasundSystemdistzuraufdellieruEcundhulationtzeit-Anonwysiologis-endunghenausgelegt,sodaVitalfunktionendieserdenf?rEinzelnendorgestelltieunmedizinischheAnhandAuonsbildungallbb(z.B.esondersdynamiscwicSimhdtigsist.vSSystems)perdeneziellemoHardwVare-aufScN?tzlichneitittstellenEinsatz(IBPSystems,mediziniSaO2,heECG)uwurdenunf?rhdieundEmewulationZus?tzlicvwonBaquasi-eces'schNetzetenez?glicPSimaundtidellierungenoten-Vital-kPenarameterdellen,enetenfallswicmkrelt,Bedeutungdiepheineheexiblorg?ngeeunErwrseiterunghdesAbscmediwirdzSystemiDemonstrationnisconhenKSimzurulatorserbinderVerl?sslicergleiceithonzurysiologie-MoniFr-Ger?tenull-ScaledieSimenfallsulatorenwieerm?glicwirdhen.sehrInmiteinemysiologiscdetailliertenSimStandvderPTtenecerknhniksind.werdenrksUnivMoersitProf.yAndoftheHeidelbdergraicMedicalesianPhAbkysicserGroupProf.-ColinExpUsingerimenDierentialtalBaRadiationwTherapt:yMaUniv2010ersitReviewyJ?rgenofReinhaMannheimProf.ThesistkinsonPhysioSimdeling-AlgebAAndFSystemsullDynamicHayrd-NetAndoSoftApplicanwCiamakaaireyPhysiological31st,SimulationExpEnvironmenttApplyingers:ADr.HybHesserridDr.ApprroachM?nnerBasedDr.OnAHierarchicalDieseEhrenwk?hrtlicheheErkl?orungdenIcStellenhhvinersicFhere,eh?rdedassdieenvalsorliegendeennArbheiteitohnehHilfe?hnlicDritternoundeinerohneorgelegen.BenMaiutzuCiamakng6anderertnommenenalswurdendersolcangegebkenentlicQuellengemacundt.HilfsmittelArbvhatongleicmirerangefertigtderwurde.herDieormauscdenkbPr?fungsbenvutztenMannheim,Quellen31.w2010?rtlichAboaidersinngem??ZitatDanksagungn...icIiwishedwtoseilivhaftlicehlicdelibsolceratelyd,tetoheficroBer?hrungnundtalsontheitlyterdisziplin?rethekessenereinitiallfactshstofheslife,enandgeholfenseevifAnsicIhcouldhnotersplalseaganzrnThoreauwhathitehadArbtoare,teacphh,Asanddiesenot,aufwhenStelleIdencamemirtohdie,hdiscocvoerAufmthatLeistungImithhiedenenaThemendtennotam.livonned...hHenryErfahrungenDaevideThoreauerw(1817-1862)hDreiandhalbscJahrehDissertationszeitraum,oneineDieZeitErfahrungendereinunivArbersit?tspneolitisceit,hendieUmHwPhelzungen,ndinhedenenhologiscicekteht.meinerGelegenheitZugeh?rigkdankbareitResultatzuAndencUnivhersit?tenhenMannheim,en,Heidelbeierg,dderpTt,echnihnis-wissensccDiskussionen,henMeinInformatikeinfac(TI),durcdemterungInstitutenf?rerbringen.Computergest?tztehMedizinvielen(IerscCM)wissenscohenderunddemhKlinikuminMannheimknicDadurchkttemehrcwirklict?glichneuesicsammelnhermeinwPar.ektivObreicwhohleitern,solcMenscheundZeitenWissenmithaftler,GewissheitnacderdemFvorscH.D.h(s.o.).ungGesamnicdie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