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Écrit par
Richard Salacha
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Thesee
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ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE
UNIVERSITE DE LA MEDITERRANEE
FACULTE DES SCIENCES DE LUMINY
THESE
Présentée et soutenue publiquement le 11 Juin 2010 par
Richard SALACHA
En vue de l’obtention du grade de
Docteur de l’Université de la Méditerranée
Spécialité : Microbiologie moléculaire et Biotechnologies
Les Patatines de Pseudomonas aeruginosa :
Sécrétées ou non Sécrétées ?
Telle est la question…
Composition du JURY :
Monsieur le Professeur James STURGIS Président du jury
Madame le Docteur Kim HARDIE Rapportrice
Monsieur le Docteur Christophe BELOIN Rapporteur
Monsieur le Professeur Alain FILLOUX Examinateur
Monsieur le Docteur Romé VOULHOUX Examinateur
Madame le Docteur Sophie BLEVES Directrice de Thèse
Citations
Citations
Voici quelques citations clés pour moi, qui m’ont permis d’enchaîner les manips et les
journées au laboratoire, malgré les déceptions passagères.
Ø « Un problème sans solution est un problème mal posé »
Albert Einstein
Ø « Rien n’est plus proche du vrai que le faux. »
Albert Einstein
Ø « Si vous ne pouvez expliquer un concept à un enfant de six ans, c'est que vous ne le
comprenez pas complètement»
Albert Einstein
Ø « La théorie, c'est quand on sait tout et que rien ne fonctionne. La pratique, c'est
quand tout fonctionne et que personne ne sait pourquoi. Ici, nous avons réuni théorie
et pratique : Rien ne fonctionne... et personne ne sait pourquoi ! »
Albert Einstein
Ø « Je n’ai pas échoué, j’ai trouvé dix mille façons qui ne fonctionnent pas. »
Thomas Edison
Ø « Vivre est la plus belle des choses. La plupart des gens se contente d’exister. »
Oscar Wilde
Ø « Si ce n’est aujourd’hui, ce sera demain. Rappelons-nous que la patience est le pilier
de la sagesse. »
Frédéric Mistral
Ø « You can’t always get what you want, but if you try sometime, you just might find you
get what you need »
Mick Jagger
Ø « En essayant continuellement, on finit par réussir. Donc plus ça rate, plus on a de
chances que ça marche. »
Les Shadoks
Remerciements
Remerciements
Pour venir à bout d’une thèse, il faut du soutien. Alors commençons par le
commencement, je voudrais remercier les personnes qui m’ont permis de faire cette thèse, et
surtout, de la terminer.
Tout d’abord, au commencement fut le Dr. Dominique Jourdheuil-Rahmani qui m’a
conseillé à plusieurs reprises lorsque je n’étais qu’au lycée. C’est grâce aux discussions que
j’ai eu avec elle que j’ai pris la décision d’étudier la biologie à la faculté, ce qui m’a conduit à
passer ma thèse. Merci Dominique.
Ensuite, je voudrais remercier le Professeur Andrée Lazdunski dont j’ai suivi certains
cours de microbiologie lors de ma maîtrise. Au travers de ses enseignements, elle a su nous
montrer à quel point la microbiologie pouvait être intéressante. Par la suite, j’ai eu la chance
de la côtoyer au laboratoire, de pouvoir profiter de son impressionnante mémoire et de son
immense savoir, et chacune de ces interventions ou chacun de ses conseils étaient de réelles
leçons pleines de justesse et d’intelligence.
Monsieur Alain, je te remercie pour avoir laissé à Sophie la liberté de prendre en stage
de Master un non-initié aux expérimentations en laboratoire en général, et à la microbiologie
en particulier. Malgré ton départ, je n’oublie pas l’aide que tu as pu m’apporter lorsque j’en ai
eu besoin au début de ma thèse, et je t’en remercie d’autant plus. Et puis je te remercie d’avoir
choisi Londres, en t’éloignant, tu as enfin mis un terme à la malédiction qui pesait trop lourd
sur nos épaules depuis 17 ans (et le jour où l’on se reverra, ce sera peut-être 2 Mercis plutôt
qu’un !)
Je me souviens des cours où je te prenais la tête avec mes questions anticipées, et
notamment l’une d’entre elles, chère à ta mémoire, qui s’est avérée être la plus anticipée de
toute. Je me souviens de ma surprise que tu te sois souvenue de moi lorsque j’ai téléphoné au
èrelabo la 1 fois. Je ne sais plus en revanche si je te l’ai déjà dit, mais lorsque j’ai choisi ton
sujet de stage, je n’ai pas choisi un sujet, je n’avais absolument RIEN compris à ton histoire
Remerciements
de patatine. J’ai même eu bien peur en entendant le mot « phospholipase ». Non, j’ai choisi
une personne, un encadrant. Car c’est bien la chose la plus importante pour moi, les relations
humaines. Cela fait 5 ans et des patates maintenant que je suis venu pour qu’on puisse parler
Sciences et Labo, et c’est cette rencontre avec toi qui m’a décidé à faire cette thèse. J’ai
apprécié la franchise que tu as eu avec moi, et la franchise que tu m’as permis d’avoir lors de
cette entrevue. Je pense que si tu ne m’avais pas choisi, je n’aurais pas fait de thèse. J’ai fait
semblant d’aller voir d’autres labos, mais il était hors de question que j’aille ailleurs. Depuis,
on a eu notre énorme lot de prises de têtes avec les manips, les refus diverses et variés, les
caprices de ces foutues protéines, des démêlés bioinformatiques, et aussi des moments de
soulagement, de joie et de fierté. On a aussi eu quelques prises de bec, mais j’ai un sale
caractère, c’était plus ou moins obligé. On a aussi été confronté toi comme moi à des épreuves
de la vie, qui nous ont rappelés l’importance et la vraie valeur des choses, ainsi qu’une théorie
chère à un certain Monsieur Einstein, la Relativité. Je pense que cela nous permet de nous
comprendre d’autant plus facilement. J’ai beaucoup appris au cours de ma thèse, à tous les
niveaux, que ce soit lors de ton absence pour cas de force majeur, ou ce que tu m’as inculqué.
Pour tout ce que tu m’as appris, pour la compréhension dont tu as fait preuve lorsque j’en ai
eu besoin, pour ce que tu as géré en sous-marin, pour avoir toujours tenté de me canaliser (en
me calmant ou en me remotivant), pour m’avoir laisser agir au labo avec ma philosophie de
vie sans pression désastreuse, pour t’être battue pour moi pour que je finisse calmement ma
thèse, et pour m’avoir permis de trouver un substitut au chômage, il n’y a qu’une formule :
Grazie Mille Sophie…
Mon cher Gérard, Merci pour tous tes conseils, pour tes nombreux conseils et ton
savoir encyclopédique en biochimie. Andrée est une Bible en biblio, toi en biochimie, et je
l’ai bien vite noté ! ;) Mais je voudrais aussi te remercier pour les bons moments quotidiens à
la cantine, pour les discussions foot, les cours de rugby, et les longues polémiques politico-
sociologiques. Je suis fier d’avoir réussi mon vil complot pour te débaucher lors du dernier
repas de Noël (Héhéhé). Merci Gigi !
Romé, Merci à toi, pour avoir su prendre le temps de t’occuper de moi lorsque j’en ai
eu besoin, et d’avoir su faire en sorte que le labo tourne bien, humainement et
scientifiquement, que ce soit pour les repas de Noël et les sorties d’été, ou pour la rigueur en
Journal-Club et ton management d’équipe.
Remerciements
Merci à toute mon équipe, qui sur 5 ans, a compté de nombreux membres. Comment
faire de la bio mol sans penser à Geneviève ou Chantal ? Merci à vous deux.
Thanks to THE ONE ! the special Stevie, that helps me to speak english. I hope that I
didn’t hurt too much your ears. Thank you for your patience and your help for experiments,
English and Music.
Merci à tous les fous furieux de thésards et post-docs que j’ai croisé : mon cher Junior,
mon cher Indi, mon cher Thibault, si t’existais pas, il faudrait t’inventer " Ce que tu m’as fait
rire, seul ou avec ton compère Fred, qui a bien de la patience…Courage Fred, lâche pas
l’affaire. Caro, malgré les ultra-sons qui sortent de ta voix, on a fait un excellent partenariat,
ma chère PFH, mais il va te falloir plus de reiatsu pour tacher d’améliorer ta condition de
pauvre et perfide Tom. Et je suis bien content de t’avoir attribué un point ! Merci encore à
Eric, son aide, ses conseils, et son soutien contre Thibault. Mélissa, It was a real pleasure for
me to share my bench with you,