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D´eveloppement de paquets R et valorisation de la
recherche en statistique appliqu´ee
C. Ambroise
´CNRS, Laboratoire Statistique & G´enome, Evry, FRANCE
http://stat.genopole.cnrs.fr/∼cambroiseOutline
Statistique et R
R, un langage de script adapt´e aux statistiques
´Ecrire un paquet R
De l’id´ee au code
SIMoNe
MixER
ConclusionStatistique appliqu´ee : media de diﬀusion des r´esultats
Quelle est la nature du travail?
I Comprendre les donn´ees et le probl`eme
I Mod´eliser (mod`eles et param`etres)
I Etudier les propri´et´es du mod`ele
I Estimer les param`etres (algorithme)
I Revenir `a des donn´ees r´eelles (appliquer, comparer)
Comment faire connaˆıtre ses algorithmes?
I Communication orale
I Commu ´ecrite
I Code r´eutilisable impl´ementant les algorithmesPlan
Statistique et R
R, un langage de script adapt´e aux statistiques
´Ecrire un paquet R
De l’id´ee au code
SIMoNe
MixER
ConclusionUne popularit´e grandissante
Data Analysts Captivated by R’s Power (”New York Times”, 6 janvier 2009)
Max Kuhn, directeur adjoint des tests non cliniques chez Pﬁzer :
R has really become the second language for people
coming out of grad school now, and there’s an amazing
amount of code being written for it....
You can look on the SAS message boards and see there is
a proportional downturn in traﬃc.Pourquoi R? I
Fig.: Ross Ihaka (gauche) et Robert Gentleman (droite), d’apr`es le ”New
York Times”.Pourquoi R? II
Fig.: Diﬀ´erentes ´etapes de d´eveloppement, d’apr`es ”The R journal” ...

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Catalan

Poids de l'ouvrage

1 Mo

De´veloppementdepaquetsRetvalorisationrechercheenstatistiqueapplique´eC.AmbroiseCNRS,LaboratoireStatistique&Ge´nome,E´vry,FRANCEtht:p//sat.tegonplo.encsrf./r∼cambroiseedal

OutlineStatistiqueetRR,unlangagedescriptE´crireunpaquetRDel’ide´eaucodeSIMoNeiMRExConclusionadapt´exuastatistiques

Statistiqueapplique´e:mediadediﬀusiondesre´sultatsQuelleestlanaturedutravail?IComprendrelesdonne´esetleproble`meIMode´liser(mode`lesetparame`tres)IEtudierlesproprie´te´sdumode`leIEstimerlesparame`tres(algorithme)IRevenira`desdonne´esre´elles(appliquer,comparer)Commentfaireconnaıˆtresesalgorithmes?ICommunicationoraleICommunicatione´criteICodere´utilisableimple´mentantlesalgorithmes

nalPStatistiqueetRR,unlangagedescriptE´crireunpaquetRDel’ide´eaucodeSIMoNeRExiMConclusionadapte´xuastatistiques

Unepopularite´grandissanteDataAnalystsCaptivatedbyR’sPower(”NewYorkTimes”,6janvier2009)MaxKuhn,directeuradjointdestestsnoncliniqueschezPﬁzer:Rhasreallybecomethesecondlanguageforpeoplecomingoutofgradschoolnow,andthere’sanamazingamountofcodebeingwrittenforit....YoucanlookontheSASmessageboardsandseethereisaproportionaldownturnintraﬃc.

PourquoiiF.g:RssoR?IIakahYorkTimes”.(gauche)teRobertGentleman(droite),d’apr`eselweN”

PourquoiiF.g:R?IIDiﬀe´rentesde´cembre2009.e´tapesedde´veloppement,d’apre`sehT”Rjournal”,

PourquoiR?IIIFig.:LenombredepaquetssurleCRANaconnuunecroissanceexponentielle(gauche)etmontreunre´centde´clin(droite),d’apre`sRjournal”,de´cembre2009.IRestaussitre`sdiﬀuse´deparl’enseignementehT”

PourquoiunpaquetR?IDiﬀuser:encomple´mentd’unarticleICentraliser:lestravauxd’unlaboratoireIPourlareconnaissanceetlabeaut´edelachose....ExemplesIGeneNetdeKorbinianStrimmer,Ie1071dude´partmentdestatistiquedelaTUWien,IlatticedeDeepayanSarkar.

alPnStatistiqueetRR,unlangagedescriptE´crireunpaquetRDel’id´eeaucodeSIMoNeRExiMConclusionadapte´xuastatistiques

Del’ide´eaubrouillondeprogrammeEcriturerapidedechosescomplexes1.Misesurlepapierdel’algorithme2.ProgrammebrouillonIC,Fortran,...:1a`2semainesIR,matlab:1/2a`1journe´e.

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