Correlation between Composition and Site specific Evolutionary Rate and Implications for Phylogenetic Inference

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Correlation between composition and site-specific evolutionary rate and implications for phylogenetic inference nonhomogeneous RNA models Vivek Gowri-Shankar, Magnus Rattray , School of Computer Science - University of Manchester nonhomogeneous RNA models

nonhomogeneous rna

tree time-homogeneity

single-stranded chains

site-specific evolutionary

gowri-shankar

compositional heterogeneity across

gorilla barbary

watson?crick pairs

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Correlationbetweencompositionaannddisimtep-liscpaeticoincsfeovrolpuhtiyolongaerynertaitceinferencenonhomogeneousRNAmodelsVivekGowri-Shankar,MagnusRattrayvivek.gowri-shankar@cs.man.ac.uk,magnus.rattray@cs.man.ac.ukSchoolofComputerScience-UniversityofManchesternonhomogeneousRNAmodels

Background:RNAgenesSingle-strandedchainsofnucleotides(A,C,G,U)Somecomplementaryregions(A:U,G:Cpairs)⇒foldingWatson−Crick pairsU−G pairsMismatchAGUCGAUAUACGCGAUUGAUAUCGAUCUAUAAACmetSSecondarystructurepooL23StertiarystructurenonhomogeneousRNAmodesl

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