BioChiMar - Biodiversité et Chimiodiversité Marines

BioChiMar - Biodiversité et Chimiodiversité Marines


ATELIER 2010


Nouméa, 2-10 novembre 2010




Claude PAYRI et Thierry PEREZ, organisateurs
Emmanuelle RAFFY, secrétariat et logistique




Stéphane LA BARRE, Chargé de Mission
PROGRAMME MARDI 2 NOVEMBRE

PLONGEE PASSE DE DUMBEA
Deux plongées sur la pente externe du récif, à proximité de la passe de Dumbéa
Echantillonnage d’Asparagopsis taxiformis et de gorgones (Holaxonia)diverses.
Tri des récoltes l’après-midi
VISITE GUIDEE DES MANGROVES
Avec Cyril Marchand à Nakutakoin, à proximité de la piste ULM et de celle d’aéromodélisme.
Sols hypersalins dominés par des cyanobactéries (tannes), zones à mangroves dominée par deux espèces, dont
Rhizophora spp. (dans l’eau de mer) et Avicenia marina (marais hypersalins) avec partage du terrain variant
selon les apports eau-nutriments saisonniers.
Observation de la nature des sols et des profils à partir de prélèvements par carottage de sédiments, partage
milieu anoxique et oxygéné, état de la matière organique selon les zones.

PROGRAMME MERCREDI 3 NOVEMBRE
Claude PAYRI / Thierry PEREZ Mots de bienvenue / infos sur l’atelier

SESSION BACTERIES METALLICOLES

Claude GRISON Du génie génétique à la chimie responsable et vice-versa

Les acides ulosoniques: des molécules au cœur des stratégies de défenses
Claude GRISON bactériennes: de l'expression de la virulence à la dynamique adaptive

Etude des systèmes bactéries-éponges dans les eaux polluées en métaux
Marie-Lise BOURGUET-KONDRACKI toxiques dans le Pacifique Sud



SESSION PROSPECTIVE ENVIRONNEMENT
Stéphane LA BARRE Programme KALEDO +, étude de l’holobionte corallien en Nouvelle
Calédonie et développement d’outils d’évaluation de la santé des
coraux





Stéphane LA BARRE, Chargé de Mission
PROGRAMME JEUDI 4 NOVEMBRE
SESSION CHIMIODIVERSITE

Thierry PEREZ Ecologie Chimique Marine: Indicateurs de Biodiversité et
Valorisation
Olivier THOMAS Valorisation de la chimiodiversité marine
SESSION INTERACTIONS CHIMIQUES INTERSPECIFIQUES

Cecile DEBITUS Adaptation moléculaire en milieu insulaire
Sylvain PETEK Projet Dysidea
Base de données Cantharella

PROGRAMME VENDREDI 5 NOVEMBRE
RESTITUTION DES SESSIONS

Session animée par Claude PAYRI

VISITE GUIDEE DE LA STATION AQUACOLE DE SAINT-VINCENT (IFREMER)
Avec Hughes LEMONNIER de l’Ifremer, chercheur à la Station.

PROGRAMME SAMEDI 6 NOVEMBRE

VISITE GUIDEE DES SITES LATERITIQUES DU GRAND SUD CALEDONIEN
Avec Sylvain PETEK – recherche de plantes métallicoles
PROGRAMME DIMANCHE 7 NOVEMBRE

PLONGEE BOURAIL
Avec le club de plongée local, investi dans le suivi du milieu et notamment la prolifération de Asparagopsis
taxiformis.
Deux plongées
PROGRAMME LUNDI 8 NOVEMBRE

PLONGEE NOUMEA
Deux plongées sur pente externe pour recherche parazoanthus/gorgones

Stéphane LA BARRE, Chargé de Mission
PROGRAMME MARDI 9 NOVEMBRE

PLONGEE BANC DES JAPONAIS ET ILOT MAITRE
Deux plongées le matin
VISITE GUIDEE DE SITES CHOISIS
Avec Sylvain MERLOT du LSTM – sites latéritiques du sud, Goro etc. avec recherche de plantes métallicoles
SESSION ASPARAGOPSIS – ESPECES INVASIVES

Frédérique VIARD
Laury DIJOUX : présentation du sujet de thèse dédié à Asparagopsis
Véronique Guillemard : premiers résultats en chimie obtenu sur les populations d’Asparagopsis échantillonné à
Bourail.

PROGRAMME MERCREDI 10 NOVEMBRE

RESTITUTION GENERALE
Réponse au MOI du programme ERA-NET NETBIOME.



De gauche à droite : Claude PAYRI, Stéphane LA BARRE, Cécile DEBITUS, Sylvain PETEK, Frédérique VIARD,
Thierry PEREZ, Olivier THOMAS, Mehdi ADJEROUD.
Stéphane LA BARRE, Chargé de Mission






Présentations
La réunion présidée par Claude PAYRI, DR IRD et responsable du groupe COREUS, commence par un
tour de table afin que les participants se présentent. Dans l’ordre :
Laury DIJOUX, étudiante en thèse qui a travaillé sur les algues calcaires Halimeda et va maintenant
travailler sur Asparagopsis avec Claude Payri/Frédérique Viard
Olivier THOMAS, maître de conférences HDR à l’Université de Nice, métabolites secondaires des
spongiaires et des zoanthaires, métabolomiques et biosynthèse
Stéphane LA BARRE, chercheur CNRS et chargé de mission du GdR bioChiMar
Frédérique VIARD, généticienne des populations, evo-devo à la Station Biologique de Roscoff pour
coencadrer la thèse Asparagopsis.
Thierry PEREZ, chercheur CNRS au DIMAR (Université de Marseille) et coordinateur de l’ANR ECIMAR
arrivé à terme en octobre 2010.
Cécile DEBITUS, chercheur à l’IRD de Papeete (UMR SAE), chimie des spongiaires et synthèses de
métabolites à partir d’acides aminés.
Claude PAYRI, Directeur de recherche IRD, directrice de l’UR COREUS
Claude GRISON, professeur et membre du CEFE (Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive) à
Montpellier, et du GDR Ecologie Chimique (terrestre), spécialiste de la dynamique adaptative des
bactéries et développe un programme de Chimie Ecologique en Nouvelle Calédonie.
Sylvain PETEK, chercheur IRD, centre de Papeete (UMR SAE) travaille sur les spongiaires,
chimiotaxonomie, phylogénie et bases de données interactives.











Stéphane LA BARRE, Chargé de Mission
Claude PAYRI :
L’atelier de Nouméa est animé par le pôle Biodiversité du GdR Biochimar, dont les responsables sont
T. Perez et C. Payri. Les financements de cet atelier concernent le GOPS (grand observatoire du
Pacifique sud) dirigé localement par Bernard Pelletier et le GdR BioChiMar dirigé par Ali Al Mourabit.
Le choix de la Nouvelle Calédonie pour cet atelier se justifie par son écologie récifale complexe et
variée, tous les types de récifs, climat et géologie et position géographique favorables, forte
biodiversité et taux d’endémisme elevé pour certains groupes ; affinités avec les faunes et flores
tropicales, tempérées voire froides dans le sud de l’ile (plusieurs taxons partagés avec la Tasmanie et
la Nouvelle Zélande).

L’IRD a pour missions l’aide au développement des pays du Sud en général et des ROM/COM en
particulier notamment dans ses implantations en Nouvelle-Calédonie et en Polynésie française, et
peut proposer dans ce cadre des outils pour l’analyse et la préservation de biodiversité.
Les quatre pistes de réflexion proposées ici :
- études d’interactions entre espèces, avec focus sur les espèces proliférantes (autochtones ou
introduites) vs. espèces autochtones, effets des blooms etc.
- études d’interactions hôtes-associés (ex. agresseurs-agressés), euca-euca, proca-euca
- métabolites secondaires e.g. gorgones et extinctions massives de certaines espèces
- impacts des métaux lourds en milieu ultrabasique et effets divers sur les organismes
lagonaires après lessivage des terrains.

Claude PAYRI
Etablir un état de l’art initial, rédaction concise de projets de recherche et profilage de l’audience et
partenaires potentiels (comment les approcher, avec quel type de collaboration, bourses etc.) puis
prospections en plongées pour constats en appui des projets, établir les groupes biologiques, et les
problématiques prioritaires.
Certains thèmes pourraient faire l’objet de projets à déposer dans le cadre des AAP ANR, projet
européen Eranet NETBIOME, d’autres intéressent plutôt le territoire (Fonds Pacifique, AAP du MOM,
ZONECO…) ou les privés etc.
Fabrice Colin, chargé de mission pour la Recherche auprès du Gouvernement de la NC a souhaité
assister aux présentations de la session 1 (bactéries métallicoles).

Thierry PEREZ
Le GdR, deux réunions plénières et plus d’un an d’existence à la suite d’ECIMAR. Trois écoles
thématiques, bourses de congrès pour une douzaine d’étudiants pour participer à une réunion
internationale.
Rôle fédérateur du GdR et besoin de souder les intérêts des membres autour de consortia et être le
plus performant possible sur des demandes.

Organisation
Sor