Space of Gene Species Trees Reconciliations and Probabilistic Models

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Jean - Philippe Doyon1

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Space of Gene/Species Trees Reconciliations and Probabilistic Models Jean-Philippe Doyon1,2 Cedric Chauve3 Sylvie Hamel2 1- LIRMM, Universite Montpellier 2 and CNRS 2- Departement d'Informatique et de Recherche Operationnelle, Universite de Montreal 3- Department of Mathematics, Simon Fraser University Integrative Post-Genomics Lyon, November 2009

introduction reconciliation

departement d'informatique et de recherche operationnelle

probabilistic framework

integrative post-genomics

universite de montreal

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SpaceofGene/SpeciesTreesReconciliationsandProbabilisticModelsJean-PhilippeDoyon1,2CedricChauve3SylvieHamel21-LIRMM,Universite´Montpellier2andCNRS2-D´epartementd’InformatiqueetdeRechercheOpe´rationnelle,Universit´edeMontr´eal3-DepartmentofMathematics,SimonFraserUniversityIntegrativePost-GenomicsLyon,November2009

IntroductioneRoccnliaiitnopScaexElporationProbabilisticfaremowkrGeneFamilyEvolutionTheevolutionofagenomeisdeterminedbySpeciation(•),Duplication(),andLoss(•.)xEepiremntalWhyitisimportanttostudytheevolutionofhomologousgenes?•Orthologousandparalogousgenes•Genecontentofancestralgenomes•PhylogenomicResultsConclusion

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