Savoirs, pratiques et dynamique de la diversité génétique :

/_/_ /_/_/_/_/_/_/_/_/ UNIVERSITE MONTPELLIER II SCIENCES ET TECHNIQUES DU LANGUEDOC T H E S E pour obtenir le grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITE MONTPELLIER II DISCIPLINE : Biologie des populations ECOLE DOCTORALE : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences et environnement par Adeline Barnaud Savoirs, pratiques et dynamique de la diversité génétique : le sorgho (Sorghum bicolor ssp. bicolor) chez les Duupa du nord Cameroun Soutenue le 23 mars 2007 à 14h30 devant le jury composé de : MM. Philippe Brabant, Professeur, INA-PG Rapporteur Christine Padoch, Professeur, Jardin Botanique de New York Rapporteur Bernard Godelle, Professeur, Université Montpellier II Examinateur Eric Garine, Maître de conférences, Université Paris X- Nanterre Exam Hélène Joly, Chercheur Cirad Directrice de thèse Doyle McKey, Professeur, Université Montpellier II Co-directeur Jean-Louis Noyer, Chercheur Cirad Membre invté Diversité des plantes, diversité des disciplines, diversité des lieux, diversité des rencontres, diversité des apprentissages … Cette thèse s’achève et ce document commence par les indispensables remerciements pour tous ceux qui m’ont accompagnée et m’ont apportée leur aide et leurs conseils dans les petites choses et comme dans les grandes. Je voudrais remercier ceux qui ont accompagné cette thèse au fil des jours. Merci Hélène d’avoir encadré cette thèse qui t’a conduite jusqu’au pays Duupa. Merci beaucoup pour ton soutien et ta disponibilité pour les discussions scientifiques et personnelles. Doyle, merci d’avoir toujours été présent aux moments clés de la thèse, mais aussi et surtout pour ta gentillesse et tes encouragements. En plus de mes deux directeurs, Eric Garine s’est énormément impliqué dans l’encadrement de cette thèse. Merci beaucoup d’avoir pris le temps de m’accompagner dans les méandres de l’anthropologie et de m’avoir fait partager votre regard et vos connaissances sur les Duupa. L’encadrement de ma thèse ne serait pas complet sans Monique Deu. Merci beaucoup de ton investissement et de ta présence pendant cette thèse. Merci pour toutes ces discussions et pour ton accueil toujours chaleureux au CIRAD. Cette thèse est indissociable du Cameroun et de tous ceux dont j’ai eu la chance de croiser la route. Je remercie de tout cœur les Duupa pour leur générosité indéfectible, leur chaleur, et leur hospitalité. Ils ont partagé leur savoir et leur temps avec moi (même si le plus souvent mes questions ont dû leur paraître des plus saugrenues). Je remercie tout particulièrement les habitants de Wanté mais aussi les villages de Hom, Hoy, Nogi, Sari, Seri, Sinté. Ils sont trop nombreux pour les citer tous, mais je pense à tous ceux qui ont participé à cette étude ou qui ont partagé ma vie au Cameroun. Ils ne se passent pas un jour sans que ma mémoire ne laisse s’échapper un souvenir des moments partagés, leurs sourires et leur gentillesse m’accompagnent encore aujourd’hui. Cette thèse n’aurait pu se faire sans Célestin Khasah et Simon Monné qui m’ont guidée au pays Duupa. Merci de vous être enthousiasmés pour cette étude et d’avoir parcouru la brousse en quête d’informations et pour ces discussions le soir sous les étoiles. Célestin, ta curiosité et ta présence ont fait de ces missions un régal. Simon, je ne peux pas reproduire par écrit le jeu de tes mains quand on discutait de la sélection « les panicules grosses comme ça… », mais ce détail est le symbole de nos discussions et de nos rires. Au Cameroun, il y aussi Aboubakar Moussa et la MEADEN dont le soutien technique a grandement facilité mes missions. Aboubakar, je voudrais aussi te remercier de ton accueil dans ta famille à chacun de mes passages à Garoua qui m’offrait chaleur et repos. Merci aussi pour ces échanges qui m’ont permis de mieux comprendre et de mieux accepter ce que je vivais. Adidja, un grand merci pour ton accueil si chaleureux. Quand je pense à ces missions, ma mémoire me conduit tout droit à Poli où Aïcha et Oumar m’ont ouvert les portes de leur maison. Béatrice, Carole et Delphine merci d’avoir partagé ma vie au Cameroun et de m’avoir emmener dans vos ballades. A poli, je voudrais aussi remercier le Lamido, Gilbert Mocto et beaucoup d’autres encore. Une grande partie de ces travaux de thèse aurait été impossible sans une collaboration étroite avec la Sodecoton. Les essais expérimentaux ont été initiés grâce à Krishna Naudin et poursuivi grâce à Oumarou Balarabe. La réussite de cet essai expérimental n’aurait pas été possible sans l’enthousiasme et l’implication Esae Oin koïda qui a géré cet essai et de Justin Bolteu qui a pris les mesures pendant un cycle avec rigueur et intérêt. Merci aussi à ceux qui ont participé à cet essai. Cette thèse est le fruit d’un travail interdisciplinaire qui n’aurait pas été possible sans l’aide précieuse et avisée de spécialistes de chaque discipline. Merci à tous ceux qui m’ont aidé dans le cadre du comité de thèse, de précieuses discussions et de temps partagé : Jacques Chantereau, Sophie Caillon, Marie Hélène Chevalier, Christian Leclerc, Jean-Louis Pham, Christine Raimond, Thierry Robert, Fabrice Sagnard, etc… Merci également aux membres de mon jury de thèse et tout particulièrement aux rapporteurs d’avoir évalué cette thèse. Je voudrais aussi remercier ceux qui ont relu et corrigé tout ou une partie de cette thèse : Eric Garine, Sophie Caillon, Marie-Hélène Chevalier, Monique Deu, Hélène Joly, Doyle McKey, Jean- Louis Noyer. Comme beaucoup le savent l’orthographe est un de mes nombreux défauts. Et si en lisant cette thèse vous ne trouvez que quelques fautes, la gloire en revient à tous les relecteurs amusés et le plus souvent désespérés qui se sont prêtés au jeu : Anthony, Alex, Audrey, Hélène, Laure, Julien. Tous mes remerciements vont à tous ceux que j’ai croisé au CEFE et particulièrement l’équipe coev : Anne, Anthony, Bertrand (3 ans de vie de bureau animée !), Cat, Chantal, Christian, Céline, Claudine, Daniel, Edmond (saveur indescriptible du Nutella après 5 semaines de brousse et de sardines-riz), Finn, Géo, Ghislain, Guillaume, Hélène, Julien, Karine, Marie, Marie-Hélène, Maryse, Laure (merci pour toute ton aide), Laurence, Laurent, Magali (Cette thèse est indissociable de ta présence et de ton amitié que de moments partagés !), Martine, Mas, Mélanie, Nopol, Rolland, Roumsais, Yldiz… Et les anciens qu’il est impossible d’oublier Ben, Bruno, le Gigot, Mathieu, Nadir. Le sorgho et la génétique m’ont conduite au CIRAD et particulièrement à Biotrop, merci à tous, pour tous ces moments partagés et ces fructueuses discussions : Anna, Angel, Ange-Marie, Brigitte, Elodie, Fabien, Fabrice, Caroline, Claire, Jacques, Jean-Louis, Jeff, José, Julie, Loïc, Lucio, Nadège, Marc, Monique, Mumu, Olivier, Ronan, Roger, Sophie et beaucoup d’autres encore… Sur le chemin qui m’a conduite vers cette thèse, merci à Jean-Louis Noyer en maîtrise et Agnès Doligez et toute l’équipe génétique vigne en DEA pour m’avoir initiée à la recherche et accompagnée vers et pendant la thèse. 3 ans de thèse, c’est aussi 3 ans de vie partagés avec mes amis qui ont toujours été là aux moments forts de cette thèse et l’ont aussi merveilleusement égaillée : les amis d’ici et d’ailleurs, de thèse et de toujours… En dernier lieu mais mon remerciement n’en est que plus fort à ma famille qui m’a soutenue, encouragée dans mes rêves et à toi Stéphane pour ton infinie patience et beaucoup plus encore. Merci à tous pour tout … Sommaire Liste des Figures __________________________________________________________________4 Liste des Tableaux_________________________________________________________________6 Liste des Annexes7 INTRODUCTION ________________________________________________________________8 CHAPITRE 1 : Le sorgho : biologie, culture et agriculture chez les Duupa _________________ 14 1 Le sorgho : Sorghum bicolor ssp. bicolor _____________________________________15 1.1 Position taxonomique ________________________________________________15 1.2 Histoire évolutive____________________________________________________16 1.3 Biologie de la reproduction et flux de gènes ______________________________17 1.4 Diversité génétique __________________________________________________18 2 Le sorgho : un objet pensé et cultivé dans la société duupa ______________________18 2.1 Les Duupa _________________________________________________________18 2.2 Organisation sociale de la communauté et organisation du travail agricole ____19 2.3 Organisation spatiale du terroir ________________________________________21 2.4 Le sorgho au cœur de la société duupa __________________________________22 2.4.1 Une place récente mais importante______________________________________22 2.4.2 Usages alimentaires _________________________________________________22 2.4.3 Les autres rôles ____________________________________________________23 2.5 La culture du sorgho24 2.5.1 Culture prépondérante _______________________________________________24 2.5.2 Calendrier agricole __________________________________________________24 3 Comprendre la dynamique de la diversité des plantes domestiquées : le sorgho chez les Duupa_______________________________________________________________________27 CHAPITRE 2 : Taxonomie locale, Variabilité phénotypique et génétique __________________28 1 Identification et classification des sorghos par les Duupa _______________________30 1.1 Une approche anthropologique : méthodologie ___________________________30 1.1.1 Entretiens, questionnaires et discussions informelles ________________________31 1.1.2 Liste libre, tri par piles et consensus _____________________________________31 1.2 Nomenclature des sorghos duupa _____________________________________