UNIVERSITE LOUIS PASTEUR MASTER VIE ET SANTE PROGRAMME DES COURS Spécialité PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE Domaine : Sciences Master Mention Vie et Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire Responsables pédagogiques du master : Dr G. Prévost Pr S. Bahram UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie Centre de Recherches d’Hématologie de la Faculté de Médecine, et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, 4 rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. F-67085 Strasbourg cedex Tel : 03 90 24 37 57 Tél. : 33 3 90 24 39 92 Fax : 03 88 25 11 13 Fax : 03 90 24 40 16 E-mail : gilles.prevost@medecine.u-strasbg.fr E-mail : siamak@hemato-ulp.u- strasbg.fr Pré-requis (exemples de cours) : • Bases académiques indispensables Biologie cellulaire et moléculaire, éléments de physiologie • Types de profil admis dans cette formation Licences de Biologie, Biologie cellulaire, et Physiologie Licences de Biochimie et Biologie Moléculaire Les dossiers extérieurs à l’ULP seront évalués par la commission pédagogique (Juin, juillet, septembre de chaque année) Masters 2 accessible depuis ce Master : Biologie Cellulaire Intégrée (de plein droit), d’autres spécialités sur examen des dossiers en fonction des options validées par le candidat. PROGRAMME DES COURS - UNIVERSITE ...
Domaine : Sciences Master Mention Vie et SantéSpécialité Physiopathologie Cellulaire et MoléculaireResponsables pédagogiques du master :Dr G. Prévost Pr S. Bahram UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie Centre de Recherches d’Hématologie de la Faculté de Médecine, et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, 4 rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. F-67085 Strasbourg cedex Tel : 03 90 24 37 57 Tél. : 33 3 90 24 39 92 Fax : 03 88 25 11 13 Fax : 03 90 24 40 16 E-mail :gilles.prevost@medecine.u-strasbg.fr : E-mailu.-siamak@hemato-ulp strasbg.fr
Pré-requis (exemples de cours) : • Bases académiques indispensables Biologie cellulaire et moléculaire, éléments de physiologie • de profil admis dans cette formation Types Licences de Biologie, Biologie cellulaire, et Physiologie Licences de Biochimie et Biologie Moléculaire ’ Les dossiers extérieurs à l ULP seront évalués par la commission pédagogique (Juin, juillet, septembre de chaque année) Masters 2 accessible depuis ce Master : ’ Biologie Cellulaire Intégrée (de plein droit), d autres spécialités sur examen des dossiers en fonction des options validées par le candidat.
PROGRAMME DES COURS - UNIVERSITE LOUIS PASTEUR MASTER VIE ET SANTE Spécialité PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIRE Vingt cinq unités de recherche (INSERM, CNRS, EA) soutiennent cette formationmultidisciplinaireàlarecherch’emédicalesurlesthèmesdelacancérologie, la génétique humaine, l immunologie, la microbiologie médicale, et de la biologie et médecine de la reproduction. La formation développe la transversalité, la communication scientifique et le rapprochement rapide vers le monde de la recherche avec des e’xpériencespratiquesenlaboratoirespermettantauxétudiantsd acquérir une vision précise et dynamique des possibilités de recherche etdesapprochesnécessa’irespouvantrépondreauxprobléma’tiques’dela Santé Humaine. Loin d être un enseignement médical, il s agit d un enseignement fondamental axé sur la biologie humaine et ses mécanismes pathologiques. La formation Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire est adaptée aux étudiants scientifiques, médecins, pharmaciens ou dentistes.BILAN d’exercice ’ Nombre d inscrits 2005-2006 M1 : 87 inscrits, soit 57 IA dont 19 étudiants scientifiques + 30 IP ; M2 : 23 étudiants (9 étudiants du secteur Santé)Résultats sessions 2006 : M1 : 17 reçus (étudiants scientifiques) en juin / 19 reçus définitifs. Le cas des étudiants du secteur Santé est particulier puisque validant M1 sur plusieurs années ; 68 étudiants du secteur Santé se sont inscrits, 54 étudiants ont validé de 3 à 30 crédits au cours de 2005-2006, 17 étudiants sont désormais titulaires du Master Vie et Santé, spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire au titre de 2005-2006.M2 : 16 reçus en juin, 23 reçus définitifs. ’ 11 étudiants continuent en thèse, 2 étudiants se réorientent vers d autres Masters,2étudiantschangentdevoie,1étudiante’stenrecherchedethèse ; 7 étudiants du secteur Santé poursuivent d abord leur formation professionnelle, 2 sont inscrits en thèse, 3 au moins envisagent une thèse ensuite. ’ Nombre d inscrits 2006-2007 M1 : >95 inscrits, soit > 66 IA dont 20 étudiants scientifiques, + 29 IP ; mais projection > 100 inscrits M2 : 23 étudiants (7 étudiants du secteur Santé).
MASTER PHYSIOPATHOLOGIE CELLULAIRE ET MOLECULAIREOPTION CANCEROLOGIE jean-pierre.bergrerat@chru-strasbourg.fr ;r.fel.KURTZJ-Emmanuarbsuogrc@rh-utsjocelyn.ceraline@ircad.u-strasbg.frCalendrier Intitulé du cours Enseignant cture et organisation du génome Me 27.09.06 13h30RéplicationdellaluelceirteNDA’noisiuvritdSD. BURNOUF Me 27.09.06 15h05 du cycle cellulaire RégulationJ-P. BERGERAT Me 27.09.06 17h15 et maturation de l’ARN StructureJ. STEVENIN Je 19.10.06 17h00 de la transcription RégulationJ-M. EGLY I.Biologie moléculaire de Lu 02.10.06 8h00Physiologie des récepteurs nucléairesD. MORAS la1celluleMe04.10.0614h00terseuptceRésednoitcudsnartmitogènsignauxitrplofiseetnaatérsifB. WASYLYK 6h00Me04.10.0616h10ousesulteeschlleCes.rantlatiRéguluseeclliléfporiancontielclaludnoalefideréfrieL. MAUVIEUX Me 11.10.06 14h00erialullecenarbemMrisearanembmarsntstsportranetluleritrinelacraTcfiN. BOEHM a Me 11.10.06 15h05luiasnoitedAéiséhsonllceernttiac,ChptgyascoouqleteetmobilitytoseetE. GUERIN res Me 11.10.06 17h15 Mécanismes de l’apoptoseJ. CERALINE
Calendrier Me 18.10.06 14h00Me 18.10.06 16h10Je 28.09.06 17h00 Me 25.10.06 14h00Me 25.10.06 16h10Me 08.11.06 14h00 Me 08.11.06 15h05Me 08.11.06 17h15
Calendrier Me 15.11.06 14h00 Me 15.11.06 16h10Je 16.11.06 17h00Me 22.11.06 14h00Me 22.11.06 15h05 Me 22.11.06 16h10Me 22.11.06 17h15
Intitulé du cours Enseignant Date Surveillance de l’intégrité du génomeT. LAVAUX2h00 Transformation cellulaire et histoire naturelle desJ-P. BERGERAT2h00 cancers dommages dans2h00 l'MAéDcaNniestmmeasladdeiersépgoénnséteiqcuelelsulaaisrseoaciuéxesF. DANTZER Cancérogenèse viraleF. STOLL-KELLER2h00 Hormones et cancérogenèse (sein/utérus)P. BRETTES1h30 Biologie moléculaire des leucoses myéloïdesL. MAUVIEUX1h00 Syndromes de prédisposition héréditaire au cancerJ-M. LIMACHER2h00 FMaocdtiefiucrastieonnvsiréopnignéenméetinqtuaeusxetcancérogenèseJ. CERALINE1h30
Intitulé du cours Enseignant Date Les étapes de la progression tumorale chez l’homme : des lésions pré-cancéreuses à la métastase : aspectsM-P. CHENARD2h00 anatomo-pathologiques et moléculaires Biologie de l’angiogenèse tumoraleC. KLEIN-SOYER1h00 Biologie de l’invasion et de la métastaseM-C. RIO2h00 Cytogénétique tumoraleP. LESSARD1h30 hénotypage moléculaire dans le Idméppilisctaatgioe,nlsedpuropnosticetletraitementdescancersM-P. GAUB1h00 ns génétiques au cours de l’initiation et de la pArltoégrraetisosiontumoraleJ. ABECASSIS1h00 Antigènes tumoraux et immuno-surveillanceM. RADOSAVLJEVIC1h00
IV. Recherche en thérapeutiquesanticancéreuses12h30
Calendrier Intitulé du cours Enseignant Me 29.11.06 14h00Chimiothérapies cytotoxiquesB. DUCLOS Radiothérapie effets biologiques des radiations -Me 29.11.06 16h10oinedsfeefsttntes:optimisatalbieegopttnetrahéutpeueiqcs,itasilaiasinoiG. NOEL on - effets biologiques et développement des rayonnements particulaires Hormonothérapies : interactions avec les autres voies Me 06.12.06 14h00 signalisation cellulaire et nouvelles orientations deJ. CERALINE thérapeutiques Me 06.12.06 16h10Mécanismes de résistance aux agents anti-cancéreuxI. LELONG Développement thérapeutique : Me 13.12.06 14h00• génique ThérapieJ-M. LIMACHER • cellulaire Thérapie • Vaccinations anti-tumorales Me 13.12.06 16h10mentoppeévelDVcaicanitnosnathérapeutique:onal,em)VPH-ttiorumesalMé(ADFUBLASKERLIPJ-J.et.D re et nouveaux traitements Me 20.12.06 14h00•nticaécolaiullaibmgeCxuerécnaJ-E. KURTZ Biologie de la progression tumorale Me 20.12.06 16h10Biologie moléculaire des sarcomesJ-E KURTZ (suite et fin) Cours : 6 crédits TP en laboratoire de recherche (35h) : 3 crédits
Evaluation Ecrit 3 hRapport Tech
Date 2h 2h 2h 1h 2h 1h30 2h 2h00
Unité d’Enseignement GENETIQUE HUMAINE (Pr H. Dollfus) Helene.DOLLFUS@chru-strasbourg.frLieu des cours : salle 19 d'Anatomie Pathologique Hôpital Civil (entrée à l'arrière du bâtiment) Vendredi 29 septembre de14.00 à 16.00 Introduction générale au M1 de génétique humaine. H. DOLLFUS : de 16.00 à 18.00de nombre et de structure (I). E. FLORI: Caryotype normal Anomalies cytogénétiques Vendredi 6 octobre de 14.00 à 18.00: Le diagnostic moléculaire des maladies monogéniques. M. COSSEE, V. BIANCALANA Vendredi 13 octobre de 14.00 à 16.00cytogénétiques de nombre et de structure (II). E.: Caryotype normal Anomalies FLORI de 16.00 à 18.00: Syndrome microdélétionnel (I). E. FLORIVendredi 20 octobre de 14.00 à 16.00: Syndrome microdélétionnel (II). E. FLORI de 16.00 à 18.00: CGH sur chromosomes. S. DUMANOIR Vendredi 27 octobre de 14.00 à 16.00: Ataxies et paraplégies spastiques héréditaires et mitochondriopathies : aspects cliniques et pathologiques. C. TRANCHANT de 16.00 à 18.00: Ataxies et paraplégies spastiques héréditaires et mitochondriopathies : aspects génétiques et moléculaires. M. KOENIGVendredi 3 novembre de 14.00 à 16.00: Diagnostic pré-implantatoire et biologie moléculaire. C. MOUTOU de 16.00 à 18.00: Cytogénétique Moléculaire et DPI par FISH. P. GOSSET Vendredi 10 novembre de 14.00 à 16.00: Démences héréditaires, Parkinson héréditaire et chorée de Huntington : aspects cliniques et pathologiques. C. TRANCHANT de 16.00 à 18.00: Biochimie du Vieillissement. N. DALI-YOUCEF Vendredi 17 novembre de 14.00 à 16.00: Démences et Parkinson héréditaires : aspects génétiques et moléculaires. M. KOENIG de 16.00 à 18.00de Huntington et ataxies dominantes. D. DEVYS: Maladies à polyglutamnies : chorée Vendredi 24 novembre de 14.00 à 16.00: Anomalies de développement des membres. B. DORAY de 16.00 à 18.00 Liaisons Génétiques. M. KOENIG : Lundi 27 novembre de 8.00 à 10.00 : Ciliopathies. Génétique et Rétinopathies. H. DOLLFUS
Vendredi 1erdécembrede 14.00 à 16.00: Pathologiesdes CDG syndromes et pathologies du métaboliques de l'enfant, exemple développement liées au métabolisme du cholestérol. B. DORAY de16.00 à 18.00: Situations classiques du conseil génétique et difficultés éthiques liées au diagnostic des maladies génétiques. E. FLORI, B. DORAY, H. DOLLFUS Vendredi 8 décembre de 14.00 à 16.00: La thérapie génique. H. PUCCIOde 16.00 à 18.00: Inactivation de l'X. M. COSSEE Lundi 11 décembre de 8.00 à 10.00: Craniosténoses et FGFR. F. PERRIN-SCHMITT, B. DORAY Vendredi 15 décembre de 14.00 à 18.00: Génétique multifactorielle. J.L. MANDEL Livre recommandé : Atlas de poche de génétique 2ème édition.PASSARGEE. ; Editeur :FLAMMARION MEDECINE SCIENCES. Collection :Atlas de poche FlammarionDate de parution : 15/01/2003, 250 illustrations - 478 pages. ISBN : 2 257 121163 Lieux de cours : Salles 19 / 23 de lInstitut dAnatomie Pathologique, HUS Campus médecine Cours : 6 crédits TP en laboratoire de recherche (35h) : 3 crédits Evaluation Ecrit 3 h
Rapport Tech
1 ’M1semestre Unité d enseignement TD de BioInformatique Acquisitions de données expérimentales et banques de données (3crédits - 3 ects) . G. Prévost, C. Le Brun, P. Riegel Gilles Prévost(MCU-PH). Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email :gilles.prevost@medecine.u-strasbg.fr) Séance 1 - 28.09.2006 8h 10h30. Reherches documentaires PubMed (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), scd (http://www-scd-ulp.u-strasbg.fr/ ) et valeur dune recherche. Recherche de séquences nucléotidiques, reprise sous format FASTA, comparaisons BLAST Séance 2 05.10.2006 8h 10h00. Recherche de motifs dans les séquences nucléotidiques, sites de restrictions (thpt/:t/oo.ceb.nlscuEB/Nomni/2rettphp.xed), traduction en protéine. Sensibilisation au site http://www.expasy.org/tools/ Séance 3 09.10.2006 8h 10h00. Séquençage, rabouttage de fragments séquencés, repérage de mutations, contigs Séance 4 12.10.2006 8h 10h00. Multi-alignements de séquences nucléotidiques, applications à la phylogénétique (P. Riegel) Séance 5 19.10.2006 8h 10h00. Contrôle continu court. Etude des protéines, recherche de paramètres physicochimiques sur http://www.expasy.org/tools/ Séance 6 26.10.2006 8h 10h00. Etudes des protéines, recherche de paramètres physicochimiques, alignements, recherche de motifs. Séance 7 - 02.11.2006. 8h00 10h00. Etude des protéines. Multi-alignements, recherche de motifs. Séance 8.- 15.11.2006. 8h00 10h00. Contrôle continu court. Structure des Protéines I. PDB database, WebLab Viewer, PyMol, RasMol. Visualisation des structures, remplacement de résidus, distances atome-atome, charges organisation structurale dune protéine Séance 9 - 16.11.2006. 8h00 10h00. Structure des Protéines II Séance 10.- 20.11.2006. 8h00 10h00. Structure des protéines III Séance 11 23.11.2006. 8h00 10h00. Acquisition et traitement de données numériques II sur SigmaPlot 10 Séance 12 30.12.2006 8h30 10h30. Contrôle terminal
Evaluation
2 Cont Continus + 1 cont terminal : 3 exercices
M1 - second semestre Unité d'Enseignement "Technologies de la Biologie Cellulaire et Moléculaire" Y. Piémont -B. Jaulhac Yves Piémont(PU-PH) Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email :trasbg.fcine.u-sno@temedev.sipmeyr)Benoît Jaulhac(PU-PH) Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 80. Fax : 03 88 25 11 13. Email :benoit.jaulhac@medecine.u-strasbg.fr)Cours - conférences sur les principes, applications et limites des Techniques en Biologie Moléculaire et Cellulaire1- Enzymes de la Biologie Moléculaire / séquençage d'ADN- G. Prévost (9-12h00) 29-09-2006 2- Polymérases thermostables et applications - B. Jaulhac (9h00 - 11h00) 06-10-2006 3- Purification des protéines et marquages - G. Prévost (9h00-11h00) 13-10-2006 4- Vecteurs et systèmes d'expression procaryote/eucaryote - Prof A. Pereira (9h00-11h00) 20-10-2006 5- Cultures cellulaires P. Simon-Assman (9h00-11h00) 27-10-2006 6- Cytométrie en flux A.S. Korganow (9h00-11h00)02-11-2006 7 Techniques d'étude de l'apoptose - F. René (9h00-11h00) 17-11-2006 -8- Contrôle transcriptionnel chez les Eucaryotes L. Tora (8h30-10h30) 21-11-2006 9- Protéomique (SELDI-Tof) - M.C. Rio (8h30-10h30) 24-11-2006 10- Transgenèse N. Ghyselinck (10h30-12h30) 24-11-2006 Ouvrage conseillé : Principes de biologie moléculaire en biologie clinique. Ameziane, Bogard, Lamoril. Editions Elsevier Campus Référence ISBN2-84299-685-2 -Ces conférences feront lobjet dun examen écrit (15.12.2006, 10h00-11h30). Exposés sur les démarches scientifiques (20 et 22.12.2006, matinées)Les conférenciers ci-dessus proposent quatre à six articles liés au thème traité. Deux articles développant des techniques semblables ou parallèles seront remis à chaque étudiant. Les étudiants auront un délai de deux mois environ pour produire un résumé technologique (10 min) des articles distribués (tirage au sort ? 30.03 et 06.04) présenté si possible avec un support PW Point. Deux à trois questions de compréhension ou de regard critique sur les approches technologiques pourront ensuite leur être posées par le Jury (3-4 personnes les 04.05 , 11.05 , 18.05.2006). Un résumé de 2-3 pages sera également rendu pour étayer largumentaire (schémas bienvenus). Un membre au moins sera commun dune séance de Jury à lautre. Laudition des exposés est possible pour les étudiants du M1 Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire. Par ailleurs, la seconde partie de cet enseignement consiste pour les étudiants à réaliser un résumé "technologique" suivi d'un article (10 min orale), les intervenants devront nous envoyer, à G. Prévost ou à M le Pr Benoit Jaulhac, 2 ou 3 articles afférant avec les sujets développés. Les exposés se déroulant fin décembre (21 et 22-12-.2006), il serait souhaitable de nous envoyer ces articles avant le 15.10.
Evaluation
Résumé-01vidni5+irtcEh103ExpoechséTmin
U.E. Stratégies de Recherche sur la Cellule 2006-2007 S1 M1Anne-Catherine SCHMIT Institut de Biologie Moléculaire des Plantes anne-catherine.schmit@ibmp-ulp.u-strasbg.frMaster Vie et SantéCours à l’Amphi 2 Institut LeBel : Cours Magistraux :A.C. SCHMIT: (5h)Les supports du transport nucléo-cytoplasmiqueet leurs rôles en mitose(2 octobre, 9 octobre, 16 octobre)J. De MEY :La protéine APC (AdenoPolyposis Coli) dans le (6h) cancer du colon(6 Novembre, 13 Novembre et 20 Novembre)J.L. IMLER:NF-κB dans la signalisation de l’immunité innée(5h) (27 Novembre, 4 Décembre et 11 décembre)Programme des TP/TD : entre le 16.10 et le 10.11, salle 154H du Le BelE. HERZOG/M.C. CRIQUI:Expression transitoire(2x4h) de protéines à NLS dans des cellules BY-2Analyse darticles scientifiques(2h) G. MIREY:Culture de cellules animales (modèle : cellulesS2 de Drosophile) (2x4h) Analyse darticles scientifiques(2h) Comme l'an dernier les étudiants de physiopathologie cellulaire et moléculaire auront leurs TP/TD de SRC lasemaine 45(les lundi, mardi, mercredi et jeudi matins du 6 au 9 Novembre de 8h à 12h).Rien le vendrediGladys Mirey prends les créneaux des lundi et jeudi, Etienne Herzog celui des mardi et mercredi. ______________________________________________________________________________ Anglais CRL, Pr P. Acker et P. Candas3, CRL - 6ème étage, rue Humann Bâtiment -ETUDIANTS en M1 Volume d'enseignement nominal pour les étudiants devant valider 6 ects d'anglais, soient les étudiants d'origine scientifique, étudiants étrangers : 6 x 2 h encadré + 6 x 2 h accès libre dans les créneaux indiqués / semestre (= 3 ects / semestre) évaluation 1er semestre : expression orale + questions : faire le bilan de votre formation, besoins initiaux, difficultés et solutions trouvées, progrès réalisés et à réaliser liés à la pratique de l'anglais, et dans le cadre de votre formation évaluation 2nd semestre : compréhension écrite, expression écrite (?), compréhension orale, expression orale NB: une fiche de suivi (présence + type de travail) sera remplie à chaque passage, accès libre aux étudiants de Master les jeudis de 10h à 12h POUR TOUS LES ETUDIANTS : possibilité d'entretien de l'anglais lors des créneaux "accès libre", se renseigner Cas des étudiants de DCEM-1 : valider l'anglais dans le cursus médical Cas des étudiants > DCEM-1 : possibilité de - valider 2 x 6 h d'anglais encadré / semestre sur engagement volontaireet/ou possibilité d'entretien de l'anglais lors des créneaux "accès libre", se renseigner Etudiants en M2 intéressés et étudiants > DCEM-2 : rencontre avec Mme Candas le jeudi 29 septembre à 18h au CRL