Master Biologie - Biotechnologies

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Master, Supérieur, Master

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1 2 juin 2004 N° 3 ORGANISATION DE LA PREMIERE ANNEE M1 DU MASTER BIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIES La première année du Master de recherche en biologie et biotechnologies comporte dix unités d'enseignement de 50h (10 x 5 ECTS) et d'un TER de 100h (10 ECTS). L'organisation des UE est la suivante : Premier semestre. - 2 UE obligatoires pour tous les étudiants, se déroulant au début du premier semestre - 2 UE de pré-spécialisation au choix de l'étudiant en fonction du parcours choisi - 2 UE au choix Second semestre.

mécanismes moléculaires de la réponse innée
spécialité biologie cellulaire
physiologie cellulaire
m3
biologie cellulaire
génétiques
génétique
biochimie
cellules
cellule
m1 m2
m1-m2

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2 juin 2004

MasterBiologie–BiotechnologiesMMBBBBNN33ORGANISATION DE LA PREMIERE ANNEE M1 DU MASTER BIOLOGIE ET BIOTECHNOLOGIES La premire anne du Master de recherche en biologie et biotechnologies comporte dix units denseignement de 50h (10 x 5 ECTS) et dun TER de 100h (10 ECTS). Lorganisation des UE est la suivante : Premier semestre. -2 UE obligatoires pour tous les tudiants, se droulant au dbut du premier semestre -2 UE de pr-spcialisation au choix de ltudiant en fonction du parcours choisi -2 UE au choix Second semestre. -1 TER consistant en un travail dinitiation  la recherche selon deux formules : stage en laboratoire ou travaux en salles denseignement. Selon les disciplines le TER se concentre sur une priode dun mois ou se droule un jour par semaine durant un semestre. -4 UE au choix Ce modle doit permettre  chaque tudiant dlabor un parcours de spcialit (biochimie et nutrition, bioprocds et biotechnologies vgtales, biologie cellulaire, gntique et microbiologie, neurosciences et physiopathologies) ou polyvalent (en particulier enseignement des Sciences de la vie et de la terre). Liste des UE proposes :U obligatoirs M1 - Géni génétiqu, biologi t physiologi cllulairs (J.-P. Bohin) M2 - Immunologi, biophysiqu, biochimi analytiqu (J. Lmoin) Spécialité Biochimi t nutrition Premier semestre. MB1 – Biochimi ds mmbrans t phénomèns d surfac (A. Pirc) MB2 – Régulation métaboliqu t signalisation cllulair (F. Allain) MB3 – Tchniqus avancés n biochimi (C. Marillr )

Second semestre. MB4 – TR Formtion à l rchrch (J. Lmoin) MB5 – TR Appliction ds tchniqus nlytiqus à l biochimi limntir (M. Crpntir) MB6 – Adrssg ds protéins, modifiction post-trductionnlls (R. Ccn) MB7 – Biochimi ppliqué à l composition t à l qulité ds limnts (S. Bouqult) MB8 – Du protéom à l protéin ctiv (P. Dlnnoy) MB9 – Qulité nutritionnll t physiologi d l digstion (R. Ccn) MB10 – Génétiqu biochimiqu, xmpl ds glycosyl trnsférss (P. Dlnnoy) MB11 – Projt n biochimi limntir t nutrition (S. Bouqult) MB12 – Glycobiologi structurl t fonctionnll (J. Lmoin) Spcialit Bioprocds et biotechnologies vgtales Second semestre. MI1 – TR d Biologi t biotchnologis végétls (B. Huss) MI2 – Ls biotchnologis ppliqués à l’méliortion ds plnts (C. Rmbud) MI3 – Introduction ux bioprocédés. (P. Dhulstr) MI4 – Biologi du dévloppmnt végétl (J.-L. Hilbrt) MI5 – Génomiqu structurl t fonctionnll chz ls végétux (T. Hndriks) Spcialit Biologie cellulaire Premier semestre. MC1 – Gèns t dévloppmnt (X. Dsbins) Second semestre. MC2 – TR d'Immunologi (A. Tsimki) MC3 – TR d Biologi moléculir d l cllul niml (A. Chottu) MC4 – TR d Culturs t cycl cllulirs (X. L Bourhis) MC5 – Ontognès t oncognès (J.-P. Vilin) MC6 – Immunologi fonctionnll (M. Slzt) MC7 – Biologi ds clluls cncéruss (H. Hondrmrck) MC8 – Prtiqus xpérimntls n biologi du cncr t immunologi (X. L Bourhis) Spcialit Gntique et microbiologie Premier semestre. MG1 – Régultions génétiqus chz ls bctéris, histoir t philosophi d l génétiqu (J.-P. Bohin) MG2 – Régultions génétiqus chz ls ucryots (J.-J. Curgy) Second semestre. MG3 – TR d Génétiqu t génomiqu bctérinns (J.-P. Bohin)MG4 – TR d Génomiqu fonctionnll. (C. D’Hulst)MG5 – TR d Génétiqu ds tumurs (J.-P. Pyrt) MG6 – Génétiqu moléculir ds ucryots, génomiqu (J.-J. Curgy)MG7 – Génétiqu t pthognès bctérinn, virologi (J.-P. Bohin)MG8 – Génétiqu ds popultions, évolution moléculir, bio-informtiqu (X. Vkmns) MG9 – Génétiqu microbinn ucryot (S. Bll) 2

Spécialité Nuroscincs t physiopathologis Prmir smstr. MP1 – Communictions intr- t intrcllulirs (N. Prvrsky)MP2 – Motricité t snsibilité (M. Flmpin)MP3 – Pthologis ctulls : un défi d snté publiqu (C. Brton)Scond smstr. MP4 – TR d Rchrchs n Physiologi niml (D. Viu)MP5 – Physiologi nuromusculir (M. Flmpin)MP6 – Hormons t systèm nrvux (D. Viu)MP7 – Nuroscincs du comportmnt (S. Mccri)MP8 – Adpttions physiologiqus à ds conditions xtrms (Y. Mounir)UE transvrss Prmir smstr. M3 – Prtiqus n biologi t biotchnologis (J.-P. Vilin)Scond smstr. M4 – TR d Bio-informtiqu (H. Touzt) M5 – Bioinformtiqu t progrmmtion (M. Pupin) non nsigné n 2004M6 – Biologi cllulir t moléculir quntittiv (B. Vndnbundr) M7 – Scinc t société (M. Porcht) M8 - Histoir t Philosophi ds scincs du vivnt (Gills Dnis) M9 – Projt profssionnl (Cécil Fort) M0 – Lngus t lnggs M _ Mrkting, conomi ds produits limntirs Parcours-typ d spécialisation complt M1 M2 MB1 MB2 M3 MB3 MB4 MB6 MB8 MB10 MB12 Biochimi M1 M2 MB1 MB2 M3 MB3 MB5 MB7 MB9 MB11 Nutrition M1 M2 MB1 MB2 M3 MI2 MI3 Bioprocédés M1 M2 MB1 MB2 M3 MI1 MI2 MI3 MI4 MI5 Biotchno. végét. M1 M2 MC1 MG2 M3 TR MC5 MC6 MC7 MC8 Biol. cllulir M1 M2 MG1 MG2 M3 TR MG6 MG7 MG8 MG9 Génét. & Microb. M1 M2 MP1 MP2 M3 MP3 MP4 MP5 MP6 MP7 MP8 Nuro physiopth. Par l choix d ss UE (plus d la moitié étant libr), létudiant put optr pour un formation polyvalnt. 3

Prmir smstr du Mastr List ds unités dnsignmnt proposés :

Ls U.E. obligatoirs

M1 – Géni génétiqu, biologi t physiologi cllulair (34h cours, 16h TD). Rsponsabl J.-P. Bohin Géni génétiqu : outils bactérins (10h cours, 4h TD) J.-P. Bohin, C. Cogz, M.-A. Rcchi-Krzwinski Vcturs (plasmids, lambdas, cosmids, phagmids). Phags filamntux, présntation par l phag. Séqunag nucléotidiqu, réaction d polymérisation n chan (PCR). Mutagnès dirigé. xtrémités ds transcrits, mprints, rtard sur gl Géni génétiqu : outils ucaryots (6h cours, 6h TD) A. Chottau, . Adrianssns Transfctions. Clonag dans ls clluls ucaryots : vcturs, xprssion ds protéins. tud d’élémnts régulaturs (promoturs t nhancrs).Tst ds intractions protéiqus par dux hybrids. Biologi cllulair (8h cours, 2h TD) J.-P. Vilain, J.-F. Bodart Régulation du cycl cllulair. Cyclins t cascads d phosphorylation. Physiologi cllulair (10h cours, 4h TD) N. Prvarskaya, R. Skryma, L. Stvns Récpturs mmbranairs, cytosoliqus t nucléairs. Canaux ioniqus. Transporturs mmbranairs M2 – Biochimi t biophysiqu, immunologi (46h cours, 4h TD). Rsponsabl ?? Biochimi t biophysiqu (32h cours) Bass d la RMN, Spctrométri d mass. Cristallographi, ?? 16h Intractions protéin-ligand, . lass, 8h Modélisation moléculair, G. Vrgottn 8h Immunologi (12h cours, 4h TD) M. Salzt Structur t présntation ds antigèns. lémnts ds rconnaissancs ds antigèns (TCR, BCR) t lurs divrsités. Ls différnts vois du complémnt. Clluls t organs d la répons immunitair. Mécanisms moléculairs d la répons inné. Mécanisms moléculairs d la répons adaptativ (prmièr t scond infction). Mécanisms d modulation d la répons immunitair 4

M3 – Pratiqus n biologi t biotchnologi (50h TP/TD). Rsponsabl J.-P. Vilain. L’étudint choisir dux blocs d 25h slon son prcours. Spécialité Biochimi t nutrition - Rsponsabl C. Marillr Tchniqus danalys biochimiqus 1 25h lctrophorès bidimnsionnll, purifiction d protéins, Techniques danalyse biochimiques 2 25h Trductionin vitro,Msur dsintrctions lignd-récptur, lis.Spécialité Biologi cllulair – Rsponsabls E. Broways t K.Cailliau Exprssion hétérologu dans lovocyt d Xénop 25h Rconstitution fonctionnll d’un récptur humin tyrosin-kins dns l’ovocyt d Xénop à l suit d l’injction d’ARN. tud ds vois d signlistion impliqués dns l rpris d l division cllulir.Spécialité Génétiqu t microbiologi - Rsponsabl V. Cogz Protéomiqu t pathogns bactérinn 25h V. Cogz, J.-M. Lcroix, J. Lmoin Fcturs d virulnc d l bctéri phytopthogènErwiniachrysanthemi. Anlys ds glucns périplsmiqus osmorégulés. tud du protéom d'E.chrysanthemichz ds mutnts non virulnts. Spécialité Nuroscincs t physiopathologis - Rsponsabls M.H. Canu t B. Bastid Physiologi 1 - Physiologi intégré25h xpérimnttion niml t éthiqu. Modèls nimux d’étud ds pthologis humins. lctrophysiologi intégré : MG, CG, G, RD. L réflxologi t ls tsts d locomotion t comportmntPhysiologi 2 - Méthods danalyss moléculairs25h Imgri : microscopi fluorscnc – confocl, nlys d’img, mrqug intrcllulir…Biologi moléculir : élctrophorèss mono t bi-dimnsionnlls, immunoblots, RT PCR, hybridtion in situ, HPLC.

Ls U.E. d pré-spécialisation

MB1 – Biochimi ds mmbrans t phénomns d surfac. (30h cours, 20h TD) Rsponsabl A. Pirc Biochimi ds mmbrns : A. Pirc 15h Biochimi du cytosqultt A. Pirc 5h Trfic vésiculir A. Pirc 5h Mtric xtrcllulir F. Allin 5h MB2 – Régulation métaboliqu t signalisation cllulair. (40h cours, 10h TD) Rsponsabl F. Allain Régultion métboliqu R. Ccn 20h Signlistion cllulir F. Allin 20h MB3 – Tchniqus avancés n biochimi. (50h TP) Rsponsabl C. Marillr HPLC, CPG, lctrophorès cpillir, Modélistion moléculir, Spctrométri d mss. L M3 spécilité Biochimi doit obligtoirmnt tr pris n mm tmps qu ctt U. MG1 – Régulations génétiqus chz ls bactéris, histoir t philosophi d la génétiqu (34h cours, 8h TD, 8h TP). Rsponsabl J.-P. Bohin Régulations génétiqus chz ls bactéris (26h cours, 8h TD) J.-P. Bohin, V. Cogz, J.-M. Lcroix Suprstructur du chromosom. Régultions d l répliction, d l trnscription, t d l trduction. Strtégis d régultion bctérinns : systèms à dux composnts, cscd d fcturs sigm, ntitrminison d l trnscription, tténution trnscriptionnll, tténution trductionnll, détcturs d quorum. Histoir t philosophi d la génétiqu (8h cours, 8h TP) G. Dnis. Histoir l génétiqu à prtir d’étuds d txts (théoris d l’hérédité - Drwin, théori chromosomiqu, Mndl - d l’évolution - crétionnism, lmrckism, drwinism, néo-drwinism, néo-lmrckism - ds rltions ntr chimi t scincs du vivnt - gèn ntr protéin t ADN, doubl hélic, biologi moléculir). 6

MG2 – Régulations génétiqus chz ls ucaryots (36h cours, 14h TD). Rsponsabl J.-J. Curgy Bass d l’xprssion génétiqu chz ls ucaryots (20h cours, 8h TD) J.-J. Curgy, A. Chottau, . Adrianssns Régulations d la réplication, d la transcription, t d la traduction Régulations génétiqus chz ls plants supériurs (16h cours, 6h TD) S. Hawkins, G. Nutlings Facturs d transcriptions végétaux. Régulation transcriptionnll t modulation (mutants, transgnès) ds gèns d biosynthès ds phénylpropanods. Régulation épigénétiqu chz ls plants supériurs. MC1 – Gns t dévloppmnt (22h cours, 8h TD, 20h TP). Rsponsabl X. Dsbins Gns t acquisition ds polarités d’un mbryon :l’ax PA-PV chz l’oursin. Polarité antéro-postériur t dorso-vntral : drosophil, amphibin, oisaux, mammifèrs Gns t organogns:xmpls du mmbr t d l’œil d vrtébré, notion d’information d position Gns t différnciation tissulair:Différnciation musculair.Différnciation chondrogèn Transgns :Xénop, l’invalidation géniqu chz la souris xpérincsdgrffsmbryonnairs,cultursdcllulsnurals.MP1–Communication intr t intracllulair (40 h cours, 10 h TD). Rsponsabl N. Prvarskaya N. Prvarskaya, R. Skryma, P. Mariot, F. Vancoppnol, M. Roudbaraki, R. Cappiod Communication intr t intra-cllulair. Mssagrs ds intractions cllulairs. Jonctions d typ gap. Synapss chimiqus. Nurotransmtturs. Transduction du signal dans ls clluls cancéruss. Signalisation ds facturs d croissanc ; rl du calcium. Rl ds canaux ioniqus dans la transduction normal t pathologiqu du signal. Structur moléculair t mutations ds canaux ioniqus. MP2 – Motricité t Snsibilité (40 h cours, 10 h TD).Rsponsabl M. Falmpin.Univrsité Lill 1 : M. Falmpin, M.H. Canu, L. D-Donckr, L. Stvns Univrsité Lill 2 : M. Boucart Physiologi t plasticité du contrl motur : rl ds ganglions d la bas (pathologis t thérapis) t du crvlt. La physiologi snsorill : l systèm visul : photorécpturs, nurons cntraux, vision ds coulurs ; l systèm auditif : clluls récptrics, nurons cntraux, pathologis ; l systèm gustatif ; l systèm olfactif ; ls snsibilités propriocptivs. MP3 – Pathologis actulls : un défi d santé publiqu (50 h cours) Rsponsabl C. Brton nsignants-Chrchurs ds Univrsités Lill 1 t Lill 2 t conférncirs xtériurs invités. Présntation d qulqus grands pathologis sous form d conférncs s’appuyant sur ds donnés d bas simpls. Maladis nurodégénérativs : Parkinson, Alzhimr – Maladis nuromusculairs : amyotrophi spinal, scléros latéral amyotrophiqu, hyprthrmi malign - Ls accidnts vasculairs cérébraux - Ls ndocrinopathis t troubls métaboliqus - Ls tumurs : xmpls d pathologis cancéruss. 7

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