M1 ESPRC 2011 Mise en pratique 22
9
pages
Français
Documents
2012
Le téléchargement nécessite un accès à la bibliothèque YouScribe Tout savoir sur nos offres
9
pages
Français
Documents
2012
Le téléchargement nécessite un accès à la bibliothèque YouScribe Tout savoir sur nos offres
Niveau: Supérieur, Master, Bac+4
1 M1 ESPRC 2011?2012 Mise en pratique 22/02/2012 Concepts de base en épidémiologie, enquêtes de cohorte JL FAILLIE Exercice n° 1 Le Costa Rica et la Finlande sont deux pays disposant de registres nationaux de cancer. On souhaite comparer les taux d'incidence de cancer chez les hommes pour ces deux pays. On a les données suivantes pour l'année 2002 (source : Cancer Incidence in Five Continents, Vol. IX, 2007) : Costa Rica hommes 0?19 ans 20?39 ans 40?59 ans 60?74 ans 75 ans et + Taux d'incidence pour 100 000 PA 14,2 37,0 194,1 1166,8 2859,3 PA 842293 651146 359078 105244 36757 % 42,2% 32,7% 18,0% 5,3% 1,8% nouveaux cas 120 241 697 1228 1051 Finlande hommes 0?19 ans 20?39 ans 40?59 ans 60?74 ans 75 ans et + Taux d'incidence pour 100 000 PA 17,2 43,5 264,7 1600,5 3510,6 PA 647064 694665 763250 318343 106848 % 25,6% 27,4% 30,2% 12,6% 4,2% nouveaux cas 111 302 2020 5095 3751 PA : Personnes?années 1. Calculez le taux d'incidence brut de cancer chez les hommes pour l'année 2002 et pour les deux pays (donnez le taux pour 100 000 PA). Taux d'incidence brut (Costa Rica) = M/PA = 3337/1994518 = 167.3 pour 100 000 PA Taux d'incidence brut (Finlande) = M/PA = 11279/2530170 = 445.
Voir
1 M1 ESPRC 2011?2012 Mise en pratique 22/02/2012 Concepts de base en épidémiologie, enquêtes de cohorte JL FAILLIE Exercice n° 1 Le Costa Rica et la Finlande sont deux pays disposant de registres nationaux de cancer. On souhaite comparer les taux d'incidence de cancer chez les hommes pour ces deux pays. On a les données suivantes pour l'année 2002 (source : Cancer Incidence in Five Continents, Vol. IX, 2007) : Costa Rica hommes 0?19 ans 20?39 ans 40?59 ans 60?74 ans 75 ans et + Taux d'incidence pour 100 000 PA 14,2 37,0 194,1 1166,8 2859,3 PA 842293 651146 359078 105244 36757 % 42,2% 32,7% 18,0% 5,3% 1,8% nouveaux cas 120 241 697 1228 1051 Finlande hommes 0?19 ans 20?39 ans 40?59 ans 60?74 ans 75 ans et + Taux d'incidence pour 100 000 PA 17,2 43,5 264,7 1600,5 3510,6 PA 647064 694665 763250 318343 106848 % 25,6% 27,4% 30,2% 12,6% 4,2% nouveaux cas 111 302 2020 5095 3751 PA : Personnes?années 1. Calculez le taux d'incidence brut de cancer chez les hommes pour l'année 2002 et pour les deux pays (donnez le taux pour 100 000 PA). Taux d'incidence brut (Costa Rica) = M/PA = 3337/1994518 = 167.3 pour 100 000 PA Taux d'incidence brut (Finlande) = M/PA = 11279/2530170 = 445.
- age cas obs
- enfants de
- la pollution de l'
- de nouveaux
- le taux d'incidence
- on désire étudier le
- taux d'incidence national
- ? après
M1ESPRC2011‐2012Miseenpratique22/02/2012Conceptsdebaseenépidémiologie,enquêtesdecohorteJLFAILLIEExercicen°1LeCostaRicaetlaFinlandesontdeuxpaysdisposantderegistresnationauxdecancer.Onsouhaitecomparerlestauxd'incidencedecancerchezleshommespourcesdeuxpays.Onalesdonnéessuivantespourl’année2002(source:CancerIncidenceinFiveContinents,Vol.IX,2007):CostaRicahommes0‐19ans 20‐39ans 40‐59ans60‐74ans75anset+ Tauxd'incidencepour100000PA 14,237,0194,11166,82859,3PA84229365114635907810524436757%42,2%32,7%18,0%5,3%1,8%nouveauxcas12024169712281051Finlandehommes0‐19ans 20‐39ans 40‐59ans60‐74ans75anset+ Tauxd'incidencepour100000PA 17,243,5264,71600,53510,6PA647064694665763250318343106848%25,6%27,4%30,2%12,6%4,2%nouveauxcas111302202050953751PA:Personnes‐années1.Calculezletauxd'incidencebrutdecancerchezleshommespourl’année2002etpourlesdeuxpays(donnezletauxpour100000PA).Tauxd’incidencebrut(CostaRica)=M/PA=3337/1994518=167.3pour100000PATauxd’incidencebrut(Finlande)=M/PA=11279/2530170=445.8pour100000PA2.Lasimplecomparaisondestauxbrutsd'incidencevousparait‐elleadaptée?Justifiez.Ladistributiondel'âgesembledifférenteauCostaRicaparrapportàlaFinlandeetl'âgeestunfacteurderisquedecancer.Lasimplecomparaisondestauxbrutsd'incidencesanspriseencomptedel'âgeneparaitpasadaptée.3.Quelleméthodeallez‐vousalorsutiliserpourrendrecettecomparaisoninformative?Justifiezvotreréponseetexpliquezlaméthodeenquelqueslignes.Ils'agitdestandardisationdirecte.Onchoisitunepopulationderéférencedontonconnaîtladistributiondel'âge.Oncalculelestauxd’incidencestandardisésdesdeuxpopulationsàcomparerenappliquantauxtauxd’incidencespécifiquesparâgeladistributiond'âgedelapopulationderéférence.OncalculeleCMFquiestlerapportdestauxd’incidencestandardisés.Oncalculel'intervalledeconfianceà95%duCMF.
1
4.Effectuezlescalculsenprécisantlesétapesintermédiaires.Onprendralapopulationmondialecommepopulationderéférence.Monde0‐19ans20‐39ans40‐59ans60‐74ans75anset+TotalPersonnes‐années40000280002100090002000100000 Calculdutauxd'incidencestandardiséduCostaRica(TIsA)AgeTIPA(monde)Casthéoriques 0‐1914,20400005,6820‐3937,002800010,3640‐59194,102100040,7660‐741166,809000105,0175et+2859,30200057,19somme100000219,00TIsA=219.0pour100000PACalculdutauxd'incidencestandardisédelaFinlande(TIsB)AgeTIPA(monde)Casthéoriques 0‐1917,20400006,8820‐3943,502800012,1840‐59264,702100055,5960‐741600,509000144,0575et+3510,60200070,21somme100000288,91TIsB=288.91pour100000PACalculduCMFCMF=TIsA/TIsB=219.0/288.91=0.7585.L'intervalledeconfianceà95%duparamètreest[0.729‐0.789].Donnezvotreconclusion.L’intervalledeconfiancenecontientpas1.LeCMFestsignificativementinférieurà1.Aprèsajustementsurl’âge,letauxd’incidencedecancerchezleshommesestplusbasauCostaRicaparrapportàlaFinlande.
2
Exercicen°2Alasuited'unaccidentindustrielsurvenuen2001,leréseaudedistributiond'eaupotabled'unevilleestcontaminéparunproduitconnupourêtrecancérigène.Ondésireétudierlerisquedecancerparmilesenfantsnésdanscettevilleentre2001et2005.Unebasededonnéesestconstituéeprospectivementàpartirdetouslesenfantsnésdanslamaternitédecettevilleentrele1erjanvier2001etle31décembre2005.Uncroisementdecefichieravecleregistrenationaldescancerspédiatriquesesteffectuélepremierjanvier2006,permettantderepérerquatrecancerssurvenusentre0et4anschezlesenfantsnésdanslamaternité.Letableausuivantindique:lenombredenaissancesvivantesenregistréesparannéedanslabasededonnéesdelamaternitéetlesdonnéesnationalesderéférenceparâgepourletauxd'incidencedecancerpédiatrique.Lesquatrecasdecancerssurvenuschezlesenfantsnésdanslamaternitésontégalementindiqués.Maternitédel'étude1.01.011.01.021.01.031.01.041.01.05TauxBilanauauauauauaud'incidence01.01.0631.12.0131.12.0231.12.0331.12.0431.12.05national6 Nombredepour10naissances650600550550500PAPAvivantes0‐1an?223.11‐2ans1cancer1cancer?187.22‐3ans?195.13‐4ans2cancers?185.84‐5ans?136.0Total0‐5ans??PA:Personnes‐années1‐Dequeltyped'études'agit‐il?Ils'agitd'uneétudeépidémiologiqueobservationnelledecohorteprospective.2‐Quelestlegroupederéférence?S'agit‐ild'ungroupederéférenceinterneouexterne?Engénéral,quellesdoiventêtrelescaractéristiquesdugroupederéférencedansuneétudedecohorte?LegroupederéférenceestconstituédetouslesenfantsnésenFrancependantentrele1erjanvier2001etle31décembre2005.Ils'agitd'ungroupederéférenceexterne.Lescaractéristiquesdugroupederéférencedansuneétudedecohortesont:‐nonexposéaufacteurétudié‐issusdelamêmepopulationsourcequelegroupeexposé‐fortesimilitudeaveclegroupeexposésurtouteslescaractéristiquesayantunlienaveclamaladieétudiée(souventauminimum:âge,sexeetcatégoriesocio‐professionnelle)‐lesdifférenceséventuelles(facteursdeconfusionpotentiels)devrontêtreprisesencompteaumomentdel'analyse(diminuentlapuissancedel'enquête).
3
3‐S'agit‐ild'uneétudemixte,dynamiqueoufixe?Ils'agitd'uneétudedecohortedynamique(ououverte):l'inclusiondessujetssepoursuitaufuretàmesurequelespremièrespersonnessontsuivies,letempsdeparticipationdechacundessujetsestvariable.Dansunecohortefixe(oufermée),touslessujetssontinclusaudébutdel'étudesurunecourtepériode.4‐Quelindicateurutilise‐t‐onpourévaluerlatailled'unecohorte?Onutiliselespersonnes‐temps.Cetindicateurcorrespondàlasommedestempsdeparticipationdessujetsdelacohorte(tempsdeparticipation=duréeoùlesujetestàrisquededevenirmalade).Onutiliseleplussouventlespersonnes‐années.5‐Quelestl'avantagedecetindicateur?Ilprendencomptelessujetsquientrentdemanièredifféréedanslacohorte,lessujetsdécédés,lessujetsperdusdevue.Chaquesujetauntempsdeparticipationdansl'étude.6‐Pourcalculercetindicateurlorsquel'ondisposeuniquementdeseffectifsdesujetsàrisqueendébutd'annéeetdunombredenouveauxcasparan,quellessontleshypothèsesnécessaires?Onfaitl'hypothèsequelesdatesdesurvenuedesévénements(maladie,entréeousortied'étude)sontrépartiesuniformémentsurl'année.Danscecas,lesévénementssurviennentenmoyenneenmilieud'année.7‐Effectuezlecalcul.Onconsidérerapourcecalculquelesnaissancessontsurvenuesdemanièrerégulièretoutaulongdel'année.Maternitédel'étude1.01.011.01.021.01.031.01.041.01.05TauxBilanauauauauauaud'incidence01.01.0631.12.0131.12.0231.12.0331.12.0431.12.05national6 Nombredepour10naissances650600550550500PAPAvivantes0‐1an3253002752752501425223.11‐2ans0649.5(1K)600549.5(1K)5502349187.22‐3ans006496005491798195.13‐4ans00648(2K)6001248185.84‐5ans00647647136.0Total0‐5ans7467?LasommedesPAestde7467.
4
8‐Calculezletauxd'incidencebrutdecancerobservédanslacohortependantlapériode2001‐2005etsonintervalledeconfianceà95%.6 TI=M/PA=4/7467=535.7pour10PA2‐8Var(TI)=M/PA =7.17x10 ‐6‐8 IC95%TI=TI+/‐1.96racine(Var(TI))=535.7x10+/‐1.96racine(7.17*10 )6 IC95%TI=[12.7‐1062.3]pour10PA9‐Aprèsstandardisationsurl'âge,letauxd'incidenceobservéchezlesenfantsdelamaternitéest‐ildifférentdutauxd'incidencenational?OncalculeleSMR.AgeCasTInationalNbattdePA6 obspour10PAcas0‐1an01425223.10,321‐2ans22349187.20,442‐3ans01798195.10,353‐4ans21248185.80,234‐5ans0647136.00,09SMR=O/E=4/1.43=2.80TestdesignificationduSMR:H0:SMR=1;H1:SMR≠12 SousH0,(|O‐E|‐0.5) /Esuituneloiduχ2à1ddl.2 2 chi2=(|O‐E|‐0.5)/E=(|4‐1.43|‐0.5)/1.43=3.00<3.84(testduchi2à1ddl,seuilalpha=0.05).p>0.05Onconclutqueletauxd'incidenceobservéchezlesenfantsdelamaternitén’estpassignificativementdifférentdutauxd'incidencenational(leSMRn’estpassignificativementdifférentde1).10‐Peut‐onaffirmeràpartirdecesdonnéesquelerisquedecancerestaugmentéchezlesenfantsdelamaternité?Justifiezvotreréponse.Non,letauxd'incidenceobservéàpartird'uneétudedecohorten’estpassignificativementdifférentdutauxd'incidencenationalaprèsajustementsurl’âge.11‐Peut‐onaffirmeràpartirdecesdonnéesquel'accidentindustrielayantentraînélapollutiondel'eaudelavilleestàl'origined'uneaugmentationdelasurvenuedescancerspédiatriqueschezcesenfants?Justifiezvotreréponse.Non,letauxd'incidenceobservéàpartird'uneétudedecohorten’estpassignificativementdifférentdutauxd'incidencenationalaprèsajustementsurl’âge.Deplus,uneétudeobservationnellenepermetpasdeconclureàunliencausalentreuneexpositionetunemaladie.
5
12‐Onvouspréciseque5%deshabitantsdelavilleontdéménagéentre2001et2005.Celapeut‐ilavoirunimpactsurl'estimationdel'incidence?Comments'appellecebiais?Quepouvez‐vousproposerpourl'éviter?Oui,biaisdesélection(biaisdeperdusdevue).Celapeutavoirunimpactsurl'incidencesilacausedudéménagementestenlienavecl'expositionet/oulamaladie.Parexemple,onpeutsupposerquelesparentsdéménagentcarleurenfantestmalade;ainsilediagnosticdecancerestfaitdansuneautreville.Pourl'éviter,onpeutfairedesrecherchescomplémentairespourpréciserledevenirdecespersonnes. 5%onpeutconsidérerquelebiaisn'apasd'impactimportant13‐Commentprendreencomptelesenfantsde0à5ansayantemménagédanslavilleentre2001et2005?Cesenfantsnesontpasinclusdanslacohorte.Ilsnesontpasexposésauproduitcancérigènedepuislanaissance.Exercicen°3Pourétudierlerôleprotecteuréventueldel'aspirinesurlasurvenuedecancer,uneétudeaétéentrepriseàpartirdessujetsvenusconsulterpourunbilandesantéàlasuited'unepropositionquileuraétéenvoyée.Plusieursmilliersdeconsultantsontacceptédeparticiperetontétésuivienmoyenne12ans.Lesuivicomprenaitunquestionnaireà5anset10ansaprèsl'inclusion.Lasurvenuedecancerétaitrepéréeparlesregistresd'hospitalisationdelarégiond'habitation.Al'inclusion,oninterrogeaitlessujetssurleurconsommationd'aspirinedes12derniersmoisetdes30derniersjours.Dansl'analyse,onaconsidérécommeconsommateurd'aspirinelessujetsquiontdéclaréavoirprisaumoinsunefoisdel'aspirineles30derniersjoursavantl'inclusion:59%étaientdanscecas.1‐Dequeltyped'études'agit‐il?Ils'agitd'uneétudeépidémiologiqueobservationnelledecohorte(historico)‐prospectiveexposé‐nonexposé.2‐Lorsdel'analysedulienentrelaconsommationd'aspirineetlasurvenuedecancer,lessujetsatteintsdecanceràlavisited'inclusionoudansles2premièresannéesdesuiviontétéexclus.Pourquoi?Respectdelachronologieexposition/maladie.Unintervallede0à2ansentreexpositionetsurvenuedecancersembleunepériodetropcourtepourimputerlasurvenued'uncanceràlaprised'aspirine.Laprised'aspirinepeut‐êtredanscecasuneconséquencedelamaladieennonsacause(silepatientprésentedesdouleursparexemple).
6
